揭开肠道细菌基因组的面纱

　　

   （生物通译）基因组测序者们破译了一个细菌的亲缘关系密切的两个变种的遗传密码，其中一个变种引起伤寒症，另一个则引起食物中毒。据研究人员在10月25日的《自然》杂志上发表文章报道，比较这两个沙门氏菌 Salmonella enterica变种的基因组并与其它细菌的基因组做比较有助于科学家找到预防和治疗 这些细菌引起的疾病的更好方法。

    两种病菌都对人类造成极大痛苦。首先，Salmonella. typhi引发伤寒症。伤寒症每年在全世界范围内侵袭1千6百万人并导致60万人死亡。每年更有千百万人遭受Salmonella. typhimurium引起的食物中毒之苦。其它一些引起人类和动物肠道问题的细菌已被测序或部分测序，微生物学家希望这两个病菌的加入能够为弄清楚Salmonella引发的问题带来曙光。

    英国剑桥Sanger中心的微生物遗传学家Julian Parkhill和他的同事固定了S. typhi的染色体，他们发现了约4600个潜在的基因，其中许多与其近亲－－典型的普通无害肠道细菌Escherichia coli完全一样并且按照同样的顺序在染色体上依次排列。S. typhi与E. coli及其它S. enterica细菌基因组的比较显示S. typhi的204个基因是没有功能的。这种低效可以解释为什么它只侵染人类，因为它缺少进入其它动物的工具。

    第二种病菌S. typhimurium，由加州圣地亚哥Sidney Kimmel癌症中心的微生物学家Michael McClell和他的同事测序。当他们将S. typhimurium的4300个基因与包括那些侵染鸟类和爬行动物但不侵染人类的细菌在内的8种其它肠道细菌的基因比较时，发现大约有350个基因是侵染 恒温动物的细菌所独有的。大约有50个基因编码出现在这些有害细菌表面的蛋白质，因而可作为药物靶和候选疫苗。

    因此，“Salmonella基因组测序的完成是一个令人十分兴奋的进展，”耶鲁大学New Haven医学院的微生物学家Jorge Galán称赞说：“我们的行业期待有趣而高产的研究。”

                        －－摘译自 SCIENCE NOW 2001-10-24