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美科学家完成新月柄杆菌的基因组测序
【字体: 大 中 小 】 时间:2001年04月04日 来源:
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马里兰州Rockville基因组研究所(TIGR)的William C. Nierman领导的国际研究小组完成了新月柄杆菌的序列测定。论文发表在《美国国家科学院学报(PNAS)》上。
新月柄杆菌是一种无毒的单细胞生物,它生活在水中,与病原体有许多共同的基因。这种细菌生活在养分少的环境中,有一个含3,700个基因的环形染色体。单个新月柄杆菌细胞可分裂成两个不同类型的细胞,游动细胞和叶柄状细胞。因此它的基因组序列对于研究进化生物学的某些方面,如非对称细胞分裂的机制是有用的。新月柄杆菌是一个简单而又高度可操作的单细胞模型系统,用来研究细胞分化、非对称分裂和它们与细胞周期进程的协调关系。柄球菌属的细菌都有少于4,000个基因。”
研究人员将新月柄杆菌与其它完成测序的生物如大肠杆菌和苛养木杆菌进行了比较。对比分析可能会揭示出具有感染性的病原体如:能引起斑疹伤寒症的斑疹伤寒等病原体,病原性的一些线索。斑疹伤寒等病原体已经适应了在人体细胞中的生活,但丢失了许多独立生存所需要的基因。
研究人员写道,新月柄杆菌基因组与斑疹伤寒等病原体基因组总的比较“可能最终会帮助我们辨别出新月柄杆菌中,细胞周期正确行进所需的‘核心’细胞周期基因和那些对细胞周期起调控作用但对整个生存能力并不必需的‘外周’基因。” 斑疹伤寒等病原体普氏立克次体基因组是在1998年由瑞典Uppsala大学的一个小组测序的。
已知的在新月柄杆菌基因组中对细胞周期至关重要的基因,如ctrA、parAB和recA,在斑疹伤寒病原体普氏立克次体的基因组中都有它们的相似物。而研究者们确定,其它的柄球菌属基因,如那些编码鞭毛的基因,在斑疹伤寒等病原体基因组中就没有相似物。
对柄球菌属基因组的分析揭示出它与土壤中微生物的惊人的相似。甚至使研究人员更吃惊的是存在编码分解植物多糖,如纤维素、木质素和胶质的酶的基因,还存在转运所生成糖的运输系统,植物其实是柄球菌属细菌的热量来源。
摘自:新生命网站