microRNA靶点：这个冰山有多大？

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[生物通讯]根据“DNA产生RNA，RNA产生蛋白质”的分子生物学法则，RNA分子很大程度上被认为只是遗传信息和执行具体功能的蛋白质之间的一个过渡。但最近，越来越多的证据已清楚地表明，RNA在几乎所有动植物物种中扮演的角色远比我们早先料想的活跃。

我们知道本身不编码蛋白的小RNA能调控编码蛋白的信使RNA分子。它们与特异靶点结合，这些靶点就被降解而不是翻译为蛋白质。目前已在植物、线虫、果蝇、小鼠和人类中识别出数百个小microRNA，但由于很难识别出它们的靶点，这些小microRNA的功能还不确定。

目前为止，只有3个动物microRNA的结合靶点被识别出来，大多数专家预料这只是RNA调控基因的冰山一角。德国海德堡欧洲分子生物学实验室的Stephen Cohen和他的同事用生物信息学方法识别出果蝇Drosophila的其它RNA靶点。他们的方法和由此得出的预测靶点名单标志着科学家朝着了解microRNA如何影响动物细胞蛋白组成的目标取得了阶段性进展。

Cohen 和他的同事首先确定了早先验证的少数几个动物microRNA靶点的共同特点，然后在基因组数据库中系统地搜索类似的特点。为减小出现的“假阳性”比例，Cohen和他的同事还检查这些靶点序列在两个果蝇近亲种之间是否相似，因为“真”microRNA靶点在进化上应该是保守的。当获得这些信息后，研究小组还整合进部分完成的蚊子基因组序列的信息。

这种方法获得了含有60多个果蝇预测microRNA靶点的名单，作者按照确信度从高到低排列。这个策略正确识别出所有早先已经验证的靶点，而且这些靶点的排名都很靠前。Cohen和他的同事还精选了6个其它预测靶点，然后通过誓言方法验证他们确实是microRNA靶点。

新识别出的这些microRNA靶点不仅远远超越了原来的冰山一角，事实上Cohen和他的同事还公布了全部名单，并邀请其他研究人员检查他们所研究的基因是否可能是microRNA靶点，这预示着我们很快就能对microRNA调控机制的背后有一个更为深入的了解。（生物通编译）

全文：http://www.plos.org/downloads/plbi-01-03-stark-brennecke.pdf 

联系人：Stephen Cohen

European Molecular Biology Laboratory

D-69117 Heidelberg

Germany

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