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我国家蚕基因组“框架图”精确度高达99.95%
【字体: 】  www.ebiotrade.com  时间:2003年11月17日    来源:
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摘要:

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我国科学家今天宣布:我国已在全世界率先完成家蚕基因组“框架图”绘制工作。这是我国科学家继完成人类基因组1%测序工作、水稻基因组“框架图”和“精细图”之后,向人类贡献的第三大基因组研究成果。

  这也是迄今为止我国科学家利用霰弹法测序完成的最大的生物种基因组,共注释获得了16948个完整基因,7285个基因片段。根据生物信息学的分析推断,家蚕约有两万个基因,
其中约6000个基因为新发现。课题组在家蚕基因组结构特征、基因的组织、进化和比较基因组学方面,也获得了一批具有重要价值的理论成果。

  “框架图”由中国工程院院士、西南农业大学教授向仲怀领衔,西南农业大学和中科院北京基因组研究所合作绘制完成。根据计算机组装和数据分析结果表明,基因组测序完成了6倍的覆盖深度,所获序列覆盖了家蚕基因组的95.54%,精确度达到了99.95%,完全达到了高质量工作“框架图”的要求。

  中国是世界蚕丝业的起源地。目前以现代科技为核心,以基因组研究为平台,从家蚕入手,找到并构筑一条以突破蚕业技术、根治鳞翅目类农林害虫、开发生物药品为主要内容的“21世纪丝绸之路”,已成为各国蚕业科学家的共识,并为此展开了激烈的国际竞争。中国家蚕基因组计划项目主持人、中国工程院院士向仲怀说:“我国率先向世界公布第一个家蚕基因组‘框架图’,标志着我国在家蚕基因组研究方面已居世界领先地位,也是建立21世纪‘丝绸之路’的起点和里程碑。”

  家蚕全基因组有4亿5千万个碱基对,约为人类全基因组的七分之一,略大于水稻基因组,但科研人员仅用了5个多月的时间就完成了从cDNA文库构建到测序和组装“框架图”的所有工作,创下了基因组研究的最快纪录,并且优化了基因组测序技术,大幅度降低了研究成本,提高了“框架图”的质量和准确度。

  有关专家介绍,“框架图”的完成只是家蚕基因组研究和开发计划的第一步,其“精细图”预计在明年完成。科研人员将利用生物信息学的最新方法,对家蚕所拥有的所有基因进行注释,开展重要功能基因的基础和应用研究,并联合国内科研单位,组成攻关队伍,开展蚕丝产业化应用和模式昆虫、医学模式和生物工厂研究。

来源:北京青年报





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