生物通报道：艾滋病是一种世界范围的致命性传染病，目前可以用于治疗这种病的药物有限，而且HIV病毒对药物的抗性发展也让人很头痛。来自马萨诸塞医学院Celia Schiffer实验室的研究人员已经发现与蛋白酶抑制剂抗性有关的一种常见结构物。

HIV-1蛋白酶抑制剂是一些小分子的、竞争性的活性位点抑制剂，这些抑制剂能够结合到HIV-1蛋白酶的活性位点中心并阻止蛋白质的加工过程。从表面上看，发生在蛋白酶上的突变既能防止药物的结合但同时也阻止的正常底物的结合，因此病毒想要继续生存就可能需要其底物也发生相应的变化。

通过比较若干种“底物－蛋白酶”复合物的结构，研究人员用“底物包膜”来形容底物在与活性位点结合时的三维结构。接着，他们也确定了一个“抑制剂包膜”，它能表示出大量蛋白酶抑制剂如何在底物包膜中发生部分的结合。当抑制剂突破底物包膜纺线时，抑制剂分子就有可能接触到蛋白酶。而且，当蛋白酶在特定位点（与抑制剂包膜接触的位点而非底物包膜位点）发生突变时就会出现药物抗性。