生物通报道：蛋白磷酸化涉及很多基本细胞过程的调控，所以它是蛋白组学所分析的一个主要目标。今年年中，德国科学家已经利用高通量RNAi方式对人类基因组范围内激酶磷酸化作用网络进行了初步作图。最近来美国的研究小组利用蛋白质组新片的方法，将实验中经常用到的模式生物——酵母的磷酸化激酶网络完成了。初步结果发表在12月1日的Nature杂志上（文献1）。

据估计，蛋白的磷酸化作用会影响到大约30％的蛋白质组，是许多细胞过程的重要调节机制。目前对蛋白质磷酸化还缺乏一个生物化学基础上全面的认识。在酵母中大约只有一半激酶的作用对象是已知的，而已知进行磷酸化作用的激酶蛋白不超过160种。

现在，研究人员利用蛋白质组芯片技术（见文献2）对酵母大范围的磷酸化激酶进行了研究。在体外识别了大部分的蛋白激酶作用底物，确定了包含在1325个不同蛋白种的4000余个磷酸化反应。这些作用的底物各自起到不同的生化作用，在细胞中扮演不同的角色。根据不同的激酶，可以将它们的作用对象进行归类，这些激酶包括：激酶A家族和四个细胞周期蛋白（cyclin）依赖激酶（它们之间只有细胞周期蛋白亚单位不同）。尽管许多作用底物和激酶是处于同一个区室（compartment）或者行使同一类功能，但是也有一些激酶和它的作用底物是非常不同的。

将这些磷酸化信息与蛋白相互作用信息和转录因子结合数据结合在一起发现了崭新的调节模式。这些磷酸化结果组合成了第一代酵母磷酸化图谱。

在酵母中的许多蛋白和作用途径是十分保守的，很多在其他真核细胞中被保留了下来，所以这一新的资源将可用来研究很多其他真核生物的蛋白磷酸化的机制（生物通记者 谢菲）。

文献1：Nature 438, 679-684 (1 December 2005)

doi:10.1038/nature04187

Global analysis of protein phosphorylation in yeast[pdf下载]

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附录数据1（List of kinases analysed by our protein chip assay）

附录数据2（This file summarizes the substrate report for all the kinases tested.）

附录数据3（All 8 regulatory modules including phosphorylation links, protein-protein interaction and transcriptional regulation.）

文献2：Science 14 September 2001:
Vol. 293. no. 5537, pp. 2101 - 2105
DOI: 10.1126/science.1062191

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