本期《科学》封面故事:癌症基因组

【字体: 时间:2006年10月18日 来源:生物通

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  来自美国约翰霍普金斯Sidney Kimmel综合癌症中心Ludwig中心,及霍德华休斯医学院,南加州大学医学院,凯斯西储大学(Case Western Reserve University,CWRU),德克萨斯西南医学中心,以及Agencourt Bioscience公司等处的研究人员发布了乳腺癌和结肠癌大规模测序的研究成果,这是首次完成的大规模测序乳腺癌和结肠癌中13,023个编码蛋白的基因的工作(11个乳腺癌,11个结肠癌),为与癌症有关的突变提供了独有的视角,也为诊断和治疗提供了可能的新靶标。

  

生物通报道:来自美国约翰霍普金斯Sidney Kimmel综合癌症中心Ludwig中心,及霍德华休斯医学院,南加州大学医学院,凯斯西储大学(Case Western Reserve University,CWRU),德克萨斯西南医学中心,以及Agencourt Bioscience公司等处的研究人员发布了乳腺癌和结肠癌大规模测序的研究成果,这是首次完成的大规模测序乳腺癌和结肠癌中13,023个编码蛋白的基因的工作(11个乳腺癌,11个结肠癌),为与癌症有关的突变提供了独有的视角,也为诊断和治疗提供了可能的新靶标。

这一研究成果于9月科学快讯发布,并刊登在本期的《科学》杂志封面。


(荧光DNA片段丙烯酰氨凝胶照片。在这张图片上,从左至右65个毛细管各包含了一个不同的测序反应,在这整个实验中,像这样的反应一共需要4百万个)


人类基因组测序为辨认癌症遗传突变提供了空前的详细信息,作为对这些突变的系统分析的第一站,Tobias Sjoblom等人着力进行了编码两种常见的癌症(乳腺癌和结肠癌)中已详细了解的人类蛋白基因的测序,结果发现了189个潜在的癌症基因(严格来看),其中许多过去没有与癌症联系起来,这些基因(涉及与细胞附着 、信号转导以及转录调节有关的蛋白)在乳腺癌和结肠癌中突变的频率很高(平均可以达到90个突变,但只有一个亚型在肿瘤过程中起作用,按研究来说是平均11/tumor)。

这些研究结果表明乳腺癌和结肠癌所表现出的突变不同,也就是说有器官特异性的致癌物质的存在。并且这两类肿瘤中的突变癌症基因集合也存在着不同,甚至同一组织中不同肿瘤的基因突变也不同。研究人员表示这项研究所提供的信息也许能帮助指导设计计划中的大规模“癌症基因组”测序项目。 

链接:
Science 13 October 2006:
Vol. 314. no. 5797, pp. 268 - 274
DOI: 10.1126/science.1133427
The Consensus Coding Sequences of Human Breast and Colorectal Cancers 
[Abstract]

(生物通:万纹)


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