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454测序!研究RNAi的新技术
【字体: 大 中 小 】 时间:2006年10月27日 来源:生物通
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生物通报道:CuraGen Corporation公司旗下拥有其多数股权的子公司454Life Sciences公司,10月25日宣布,冷泉港实验室研究人员通过小分子RNA研究,发现ARGONAUTE 4 蛋白 (AGO4) 在RNA介导的DNA甲基化中有双重功能,为全面观察单个样本中的全部小RNA提供了借鉴方法。研究结果刊登于25日《Nature》,文中对454SequencingTM探测“与AGO4 和 AGO1蛋白相关的小RNA”的过程进行了描述。
生物通报道:CuraGen Corporation公司旗下拥有其多数股权的子公司454Life Sciences公司,10月25日宣布,冷泉港实验室研究人员通过小分子RNA研究,发现ARGONAUTE 4 蛋白 (AGO4) 在RNA介导的DNA甲基化中有双重功能,为全面观察单个样本中的全部小RNA提供了借鉴方法。研究结果刊登于25日《Nature》,题目为《Distinct Catalytic and Non-Catalytic Roles of ARGONAUTE4 in RNA-directed DNA Methylation》,文中对454SequencingTM探测“与AGO4 和 AGO1蛋白相关的小RNA”的过程进行了描述。
“小RNA已经成为一种遗传学控制手段,这在10年前是根本想不到的。实际上,小RNA途径的发现影响了生物学的各个领域。我们发现,许多系统中小RNA的多样性,比我们所预期的还要多的多。这个在Arabidopsi(拟南芥,一种模式植物)中取得到新发现,显示小RNA在控制整个基因组的表观结构(epigenetic organization)中发挥主导作用,”研究小组负责人、冷泉港实验室Gregory Hannon说,“传统DNA测序方法只能使我们对于动植物中存在的多种小RNA有一个大致了解,然而,454Sequencing能够帮助我们对小RNA家族成员的范围和小RNA所涉及的生理学过程的宽度有全面深入的了解。”
“Genome Sequencer 20TM系统使研究人员能够快速分析样本中所有小RNA分子的特征,” 454 Life Sciences公司分子生物学部副主席Michael Egholm说,“454 Sequencing提供优质、快速、精确的小分子RNA测序结果,为RNAi机制研究带来革命性突破。”
小RNA的作用是一个令人振奋的研究领域,其最近几年的飞速发展得益于全面、快速的高级测序技术的不断进步。小RNA在细胞生长和发育过程中发挥多种生物学功能,它们控制mRNA的稳定和蛋白合成,引发转座因子、病毒基因、转基因的转录后沉默,调节染色体组装和基因组结构。此篇是Hannon博士利用454 Sequencing研究小RNA在Nature上发表的第二篇文章。最近几个月中,许多其他研究小组利用454 Sequencing研究植物、哺乳动物和病毒中的小RNA,在Science、Nature Genetics、Journal of Virology和 Genome Research上发表了文章。Hannon博士已经将利用454 Sequencing的方法公布。(生物通记者 子元)