新颖实验:几近实时记录基因组进化

【字体: 时间:2006年11月08日 来源:生物通

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  由加州大学圣地亚哥大学的生物工程研究人员组出的一支队伍在11月的《自然·遗传学》杂志上报道了一种细菌基因组的迅速进化改变,研究人员在今天内几乎实时地观察到了这种进化。

  

生物通报道:由加州大学圣地亚哥大学的生物工程研究人员组出的一支队伍在11月的《自然·遗传学》杂志上报道了一种细菌基因组的迅速进化改变,研究人员在今天内几乎实时地观察到了这种进化。

研究人员之前公布了100多种细菌的基因组序列静电“快照”。这些细菌由导致瘟疫的细菌演化而来。这项新的研究则揭示出了这些基因组如何移向着它们的入侵目标寄主。

这项研究最值得一提的是研究的技术方法。研究人员指出,考古生物学家通过分析化石记录来研究恐龙以及其他出现在数百万年前的动物如何进化,但是大肠杆菌中,新技术赋予了研究人员观察数天内进化如何发生的能力。

已经公布的细菌基因组序列就好像一个化石记录一样。研究人员的实验证实这些基因组能够在细菌适应新的环境时快速变化。

由于过去技术的局限性,生物学家一直都是通过仔细观察少数基因中的变化或者监控细菌在适应新环境时表现出的可见特征、基因性来推测快速的细菌进化。

Palsson带领的这个研究组利用由NimbleGen Systems公司(一家以美国威斯康星为基地的生物技术公司)比较基因组测序技术来确定出实验中发生在大肠杆菌的完整一套基因的变化。

研究人员将大肠杆菌培养在一种适宜发生突变的环境中:用代谢程度很低的碳和能量源——甘油来喂养细菌。然后,研究人员从培养物中移出细胞样本并测序它们的完整基因组,从而找出使它们快速生长的突变。

这种研究进化的方法能够用于发现和分析工具,并且还可能用于发现细菌有益于人类的能力。(生物通杨遥)
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