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解析DNA-蛋白复合体结构的新方法
【字体: 】  www.ebiotrade.com  时间:2006年12月08日    来源:生物通
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摘要: 生物通报道:去年Nature杂志一篇文章报道说λ-integrase (λ-Int)能够帮助mobile DNA切开染色体、插入基因、“缝合”染色体。最近,Landy 实验室研究人员解析了一种DNA-蛋白复合体的结构。这种DNA-蛋白复合体如同“护士”,在剪接过程中辅助λ-Int。

生物通报道:人类基因组一半以上是由小片段mobile DNA(可动DNA)组成,mobile DNA在体内游动,将基因插入到靶细胞的染色体中。

去年Nature杂志一篇文章报道,布朗大学Arthur Landy实验室和霍华德修斯医学院Thomas Ellenberger实验室研究人员利用可以感染大肠杆菌的ambda病毒作为分析mobile DNA研究模型,解析了λ-integrase (λ-Int)的结构,发现这种蛋白“外科医生”,能够帮助mobile DNA切开染色体、插入基因、“缝合”染色体。

最近,Landy 实验室研究人员解析了一种DNA-蛋白复合体的结构。这种DNA-蛋白复合体如同“护士”,在剪接过程中辅助λ-Int。2006年11月17日《Molecular Cell》封面显示了复合体中DNA的三维图像。研究人员通过解析这些结构,弄清了这六种蛋白相互作用,在剪接过程中折叠DNA的机制。

文章第一作者、Landy实验室博士后孙邢岷(Xingmin Sun,音译)说,一旦弄清了这些蛋白和DNA的排列规则,就更容易研究它们的功能,进而可以观察它们在细胞中的真实活动。

孙邢岷表示解析这些DNA-蛋白复合体的结构需要一些创新,因为这是六个蛋白组成的复合体,对于X射线结晶学等标准检测方法来说体积太大了。于是他们采用了荧光共振能量转移技术(fluorescence resonance energy transfer ,FRET)。FRET常用于研究溶液中的小型蛋白复合体,这回孙邢岷利用FRET研究凝胶中的大蛋白复合体。他用荧光染料标记DNA,然后提纯蛋白,将它们置于凝胶中进行成像。当荧光在染料分子之间反射时,检测荧光的波长,并将检测数据输入由Dale Mierke(布朗大学医学教授)特异研制的软件程序。

“此次的最大突破是成功利用FRET分析大型DNA-蛋白复合体的结构,”孙说,“现在生物学家有了一种可以研究控制细胞分裂、基因表达、DNA复制等等复合体的新工具。”(生物通记者 子元)





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