科学家完成第二个非人类灵长动物基因组草图

【字体: 时间:2006年02月13日 来源:生物通

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生物通报道:美国国家人类基因组研究院(NHGRI)近日宣布,其领导下的一个多中心研究队已经将测序完成的恒河猴的基因组序列草图放入一个专门的公共数据库中免费供全世界研究团体利用。

恒河猴(Macaca mulatta)是继黑猩猩(Pan troglodytes)后第二个完成基因组测序的非人类灵长类动物,并且也是第一个测序的古世界猴。

测序结果显示恒河猴基因组与人类的基因组序列相似度为92%到95%,而与黑猩猩基因组相似程度在98%以上。因此,恒河猴为这三种亲缘关系相近的灵长类动物(人类、黑猩猩和恒河猴)的对比提供了一个理想的参考点。目前,研究人员正在测序几种其他灵长类动物的基因组,包括猩猩、绒(美洲产小型长尾猴)和大猩猩。

恒河猴的基因组测序工作由休斯顿Baylor医学院人类基因组测序中心、华盛顿大学基因组测序中心和J. Craig Venter研究所联合完成。进行测序的DNA样本来自西南生物医学研究基金会的一头雌性恒河猴。

这三个研究中心利用不同的和相补充的方法对恒河猴基因组数据进行了独立的组合。然后,J. Craig Venter研究所的研究组将这些结果合并成一个高密度的草图。这项合作测序工作也使用了已有的资源:人类基因组参考序列、已经公布的恒河猴DNA图谱资源和来自Michael Smith基因组科学中心的恒河猴指纹数据库。这一新的高治疗的组装图覆盖了恒河猴基因组的93%,这些资源将使研究人员能够进行进化比较和精确的基因预测。世界各国的研究机构目前已经能够从以下地址获得该项工作获得的序列数据:GenBankhttp://www.ncbi.nih.gov/Genbank);EMBL Bankwww.ebi.ac.uk/embl/index.html)和DNA Data Bank of Japanwww.ddbj.nig.ac.jp)。(生物通记者杨遥)

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来自纽约2月9日的消息,美国国家人类基因组研究所(the National Human Genome Research Institute,NHGRI)宣布将公布恒河猴(rhesus macaque)的基因组序列草图。

恒河猴是人类的近亲,在形态结构、生理机能和生化代谢方面同人类非常相似,应用猕猴进行研究实验的结果,很容易外推于人类。目前猕猴是仅此于黑猩猩,最接近人类的第二个完成测序的灵长类动物。

这项计划由贝勒医学院(Baylor College of Medicine),华盛顿大学(Washington University)和文特研究所(Venter Institute)共同完成,主要数据来源于圣安东尼西南生物医学研究基金的一只雌性猕猴,涵盖了猕猴恒河猴这项计划花费了两年时间,2千2百万美元。
序列见:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/
(生物通记者:张迪

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