十厘米的DNA测序仪面世

【字体: 时间:2006年04月29日 来源:RSC机构

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据RSC机构消息,太空时代的科技帮助美国研究人员开发出最小的DNA测序装置,该装置只需要1飞摩尔(femtomole)的DNA就可以进行测序。而这一DNA测序器的直径也只有10厘米,这个测序器由一系列复杂的微型泵、电子管、加热器以及电泳通路网络组成,这些构件最初都是为在火星上探测生命迹象而设计的装置上使用的。

加利福尼亚大学伯克利分校的化学家理查德-马西斯是这一测序工程的首席科学家,他将这种新的测序工具应用到了桑格(Sanger)DNA测序技术中。他使用的技术包括合成不同长度的DNA单链复制体,在每个复制体上的最终碱基上用四种不同的荧光标记物中的一种进行标识,然后将不同长度的DNA单链复制体用毛细管电泳法进行分离。

这一手动的测序器可以将三个主要的测序步骤——热循环(产生不同长度的DNA链)、样本净化、毛细管电泳分离结合成为一个单一的自动过程。由于该测序装置的尺寸十分小,所以也意味着它只需要很小一部分昂贵的化学试剂就可以进行测序过程,通常DNA测序所需的化学试剂都十分昂贵,这也大大降低了操作成本。

马西斯和他的同事们用这个测序器测试了1飞摩尔的DNA链,发现这个装置可以计算出其中最初的556对碱基,而且正确率达到了99%。目前马西斯和其同事们正着眼于开发出使这个装置的敏感性和精确性进一步提高的方法,那样的话就可以对更小的DNA样本进行测序分析。

伦敦皇家学院基因组学核心实验室负责人迈克尔-琼斯说:“这一新方法在桑格DNA测序技术的历史上建立了一个重要的里程碑。只要将模板DNA、引物和终止剂加入到这个装置中,然后喝着咖啡,在电脑屏幕前观察测序的出现,这真是令人难以置信。”


 

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