中科院重点实验室顶级杂志文章解析植物基因起源问题

　　

生物通综合：来自中国科学院昆明植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室（Key Laboratory of Cellular and Molecular Evolution）CAS-Max-Plank青年研究组（CAS-Max-Plank Junior Research Group），联合山东师范大学生命科学学院逆境植物重点实验室（Key Laboratory of Plant Stress Research），中科院北京基因组研究所(Beijing Genomics Institute)以及芝加哥大学进化与生态学系等处的研究人员发现了在水稻基因组中存在大量的逆转录转座（Retroposition）基因，这将改变了人们对植物基因组进化的认识。这一研究进展发表在最新一期的国际著名学术杂志“The Plant Cell”杂志上。

Wen Wang, Hongkun Zheng, Chuanzhu Fan, Jun Li, Junjie Shi, Zhengqiu Cai, Guojie Zhang, Dongyuan Liu, Jianguo Zhang, Søren Vang, Zhike Lu, Gane Ka-Shu Wong, Manyuan Long, and Jun Wang

High Rate of Chimeric Gene Origination by Retroposition in Plant Genomes
Plant Cell 2006 18: 1791-1802. First Published on July 7, 2006; 10.1105/tpc.106.041905 [Abstract] [Full Text] [PDF] [Supplemental Data]  

逆转录转座（Retroposition，逆转座），是一种广泛分布于动物基因组中, 可以通过反转录表达的亲代基因（parental gene）在新的基因组位置创造一个基因复制本的基因。长期以来由于在拟南芥中逆转座基因发现的很少，因而形成了一种认为逆转座在植物基因和基因组进化中并不重要的观念。

来自中科院昆明植物研究所王文博士（第一作者），及中科院北京基因组研究所的王俊教授（通讯作者）等研究人员经过研究反驳了这种观点，他们发现在水稻基因组中存在大量的逆转座基因，其中三分之一以上的逆转座基因已经获得了其他序列从而进化成了具有新功能的嵌合体基因。很多这些嵌合的逆转座基因也能在玉米、高梁基因组中找到，提示逆转座基因可能在整个草类的广适性进化中提供了重要的基因和遗传基础。此外，也有相当一部分逆转座嵌合基因为水稻所特有，说明基因的逆转座在草类基因组进化中是一个不断发生的过程，而且其速率比灵长类中高了一个数量级。
（生物通：万纹）

附：
王俊教授，博士生导师，现任中科院北京基因组研究所暨华大基因研究中心北京中心主管、生物信息学实验室主管；丹麦奥胡斯大学人类遗传学研究所及南丹麦大学人类遗传学生化及分子生物学系客座教授；北京大学生命科学学院客座教授。

1999年，王俊教授在人类基因组计划中承担了中国部分的数据分析工作。随后于2001年，在中国籼稻基因组计划中负责生物信息学分析部分。其中研究领域涉及到基因组组装、注释、表达、复制、比较基因组学、分子进化、转录调控、多态性等多个领域;发展了多个包括组装、比对、注释在内的软件算法，建立了多个数据库。

王俊教授同时还致力于脊椎动物中的基因注释问题和非编码基因问题。在2003-2004年还参与了SARS 基因组分析，组织实施了家蚕、家猪基因组计划与家鸡多态性图谱计划。

上述科研项目的成果发表在“Nature”,“Science”,“Nature Review Genetics”,“Genome Research”,“Nucleic Acids Research”等。其中以王俊为第一作者或通讯作者发表的“Nature”、“Science”这一级别文章为六篇。

王俊同时在平台搭建和大项目组织上积累了大量经验。1999年－2000年，完成了华大基因的基本生物信息学平台的搭建过程，2001年初，到杭州组建了华大基因杭州中心。组织并实施了诸如家蚕、家鸡、家猪、水稻基因组等大型计划。

介于此，王俊获得了多个奖项，诸如：“中国科学院杰出科技成就奖”、“中央国家机关优秀青年”、“香港求是科技基金求是杰出科技成就奖”、“中国十大科技进展”等。