PNAS:破译逆转录病毒基因组RNA开关的结构

　　

生物通报道：来自北卡罗莱纳州大学和耶鲁大学的研究人员破解了促使逆转录病毒基因组RNA二聚化的一个RNA开关的结构。这项研究的结果刊登在近期的《美国科学院院刊》杂志上。

 

逆转录病毒能够选择性地将大量多余的非基因组RNA包装成两个RNA基因组拷贝。基因组RNA的特别包装部分是通过识别能在5’端形成一种难理解的二聚结构的RNA来完成。

 

在这项新的研究中，研究人员鉴定、量化稳定性并利用多种实验限定条件来计算介导伽马逆转录病毒中RNA基因组间特异相互作用的一个结构域的三维模型。

 

在最初的相互作用中，来自一个RNA的两个茎环结构与第二个基因组RNA的相同结构形成高度紧密的链间“环－环”碱基对。

 

在之后的折叠过程中，这些基因组RNA间的相互作用转化成一种高亲和性、紧密的三体结构，该结构通过U形RNA单元间的交互作用来稳定。

 

这种逆转录病毒构型开关模型揭示出了一个RNA三体结构的两步形成过程如何在早期的装配步骤中产生一种紧密的分子识别事件，这些步骤能够北转化成稳定的RNA结构。（生物通记者林木）