NIH启动表观基因组研究计划

【字体: 时间:2007年11月21日 来源:生物通

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  美国国立卫生研究院(NIH)利用由“路标计划”(Roadmap plan)管理的新基金,启动了它的表观基因组学研究计划。

  

生物通报道:美国国立卫生研究院(NIH)利用由“路标计划”(Roadmap plan)管理的新基金,启动了它的表观基因组学研究计划。

 

这项称为表观遗传学技术开发的项目将会为4到8名研究人员在两年的时间里提供350万美元的经费资助。这项资助的目的是要促进开发出能够明显改善表观遗传性研究途径的创新型新工具。

 

一个附属的表观遗传技术开发计划将会提供350万美元赞助3到5个项目开发更为成熟的工具。这些技术开发资助的目标是促进表观遗传学方法用于疾病研究、诊断和预防。

 

另外一项基金则提供每年1000万美元的经费用于创立“参考表观基因组图谱中心”(Reference Epigenome Mapping Centers)。这些项目将致力于开发人类胚胎干细胞、人类分化和分化细胞、细胞系和组织的参考表观基因组。

 

另外一个项目将会在5年内为一名受资助者每年提供150万美元来发展和运作一个“表观基因组数据分析和协调中心”(Epigenomic Data Analysis and Coordinating Center),而这个中心将会支撑参考表观基因组图谱中心。该中心还会负责传递标准化数据给美国生物技术信息中心,以用于保存和公共使用。

 

“哺乳动物细胞新表观遗传标志物发现”计划将会在三年中每年提供350万美元用于严峻就,并且NIH希望能够用这些经费资助4到6个研究人员或研究中心进行研究。该资助项目的目标是建立和利用哺乳动物细胞稳定、沉默和基因表达激活的新途径。

 

另外一项附属计划将会在两年里每年提供350万美元给5到8名研究人员,以支持其相关研究。NIH表示,这个项目的目标是确定出真核生物中基因表达的活化、沉默和稳定的新途径,进而用于人类疾病病理学研究。

 

表观遗传学是与遗传学(genetic)相对应的概念。遗传学是指基于基因序列改变所致基因表达水平变化,如基因突变、基因杂合丢失和微卫星不稳定等;而表观遗传学则是指基于非基因序列改变所致基因表达水平变化,如DNA甲基化和染色质构象变化等。表观基因组学(epigenomics)则是在基因组水平上对表观遗传学改变的研究。

 

所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共价键结合一个甲基基团。正常情况下,人类基因组垃圾序列的CpG二核苷酸相对稀少,并且总是处于甲基化状态,与之相反,人类基因组中大小为100—1000 bp左右且富含CpG二核苷酸的CpG岛则总是处于未甲基化状态,并且与56%的人类基因组编码基因相关。人类基因组序列草图分析结果表明,人类基因组CpG岛约为28890个,大部分染色体每1 Mb就有5—15CpG岛,平均值为每Mb105CpG岛,CpG岛的数目与基因密度有良好的对应关系[9]。由于DNA甲基化与人类发育和肿瘤疾病的密切关系,特别是CpG岛甲基化所致抑癌基因转录失活问题,DNA甲基化已经成为表观遗传学和表观基因组学的重要研究内容。(生物通雪花)
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