在前基因组时期，构建基因调控网络是最重要的问题之一。然而，一个物种中包含有成千上万的基因，因此构建基因调控网络难度不言而喻。基于对核糖体蛋白（RP）基因近50年的研究，所以我们就可以通过这些基因更好地来理解和构建调控网络。

  RP基因的早期研究是在大肠肝菌中开始的，RP基因在原核生物中形成操纵子，一些RP蛋白还能够结合到翻译成这些蛋白的mRNA上，引起翻译的终止，在翻译水平形成一种RP基因的调控反馈网络。

  尽管在原核生物中协同调控的机制很简单，但在哺乳动物中十分复杂，因为它们的RP基因分散地存在于整个基因中而没有操纵子结构。不过，在人类基因组计划开始之前，就有多个实验证实，在不同的条件下，真核生物中的RP基因有着相类似的表达类型，它们的启动子有相似的调控能力。研究了酿酒酵母和17种真菌后，科学家们发现，在大多数的真核生物中几乎所有的RP基因都共用模体，RP基因更倾向于多种转录因子控制而不是单一的一种。

  目前对高等真核生物尤其是哺乳动物的RP基因如何协同调控转录的机制还不是很清楚，比如，转录因子和模体是怎样共同进化的？其他一些重要的调控RP基因的转录因子和模体又是什么？等等问题将会是今后RP基因研究的重要课题和方向。
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