生物通报道：在由剑桥健康技术研究所（Cambridge Healthtech Institute）在美国旧金山举办的分子医药研讨会（Molecular Medicine Tri-Conference）上，发言人指出，医药公司认为以细胞为基础的RNAi筛选是一种很有价值的药物发现工具，但是目前仍然存在诸多局限性。

在大会上，几个报告人指出，以细胞为基础的RNAi筛选在小分子靶标筛选方面具有多个优势。其中一个重要原因是，大多数细胞类型都能使用RNAi方法，并且相对较容易敲除任何感兴趣基因，并且得到的数据非常方法。

但是，这种方法仍然有一些局限性，最值得一提的是RNAi网文容易产生off-target效应。另外，几个发言人还讨论了与细胞本身有关的局限性。例如，细胞RNAi分析尤其容易产生边缘效应；一些RNAi筛选具有外显问题，在这种情况下，细胞中的GFP水平是不同类型的，因此很难解释。