中方参与建立鸣禽类cDNA新文库

【字体: 时间:2007年04月12日 来源:生物通

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  鸣禽发声学习和神经替换被广泛研究,但鸣禽研究的分子和遗传学工具却很少。最近,来自中科院遗传与发育生物学研究所和美国洛克菲勒大学、加州大学的研究人员合作,在现有数据库基础上建立了新的分子/遗传资源。

  

生物通报道:鸣禽发声学习和神经替换被广泛研究,但鸣禽研究的分子和遗传学工具却很少。最近,来自中科院遗传与发育生物学研究所和美国洛克菲勒大学、加州大学的研究人员合作,在现有数据库基础上建立了新的分子/遗传资源。文章刊登于4月10日在线版《PNAS》。

研究人员建立了斑胸草雀(zebra finch)不同发育阶段的大脑cDNA文库,其中包括随机选择的,从3’端开始测序的11,000 cDNA克隆,代表5866特异基因转录本。为clone tracking、分子测序和功能注释建立一个网络数据库。

新建立的cDNA文库并非标准化得到的,非标准化ESTs测序产生许多发育阶段特异序列,为进一步研究脑发育不同阶段基因表达提供了参考。特别是此cDNA文库来自于孵化后30-50天的大脑,与差异最大、基因表达形式丰富的快速声音系统发育和发生学习期相对应。

研究人员还鉴别出5个在斑胸草雀和其它种类鸣禽中高度保守的microRNA。研究人员设计cDNA微列阵,绘制出雄性斑胸草雀和金丝雀高级发生中心的基因表达图谱。这种高级发生中心中的基因表达差异是从微列阵杂交结果中鉴别出来的,原位杂交证实了所选择的基因。这些资源为研究鸣禽提供了一种基因组注释、比较基因组和微列阵基因表达分析工具。(生物通记者 小粥)

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