找茬游戏寻找肿瘤标记

最近，研究人员为了破译胰腺癌细胞转录的RNA，将这些RNA与正常胰腺细胞转录的RNA进行对比，寻找那些负责肿瘤生长和入侵的RNA及这些RNA翻译的蛋白。研究人员采集胰腺活检组织和健康胰腺样本，利用微列阵（或称DNA芯片）对这些样本的数千个基因转录的RNA进行定性和定量分析。

　　

生物通报道：“癌症”这个词来源于希腊语“karkinos（螃蟹）”，据说是古希腊医生Hippocrates觉得肿瘤引起的凸起的血管看上去和螃蟹腿差不多，因此给肿瘤起名为karkinos。Cancer被古英语引用，变成canker，而后来又一次被以原形引用，用来指癌症。迄今为止，癌症的治愈力还非常非常低。

细胞中的DNA是整个系统的策划者，发布RNA形式的“命令”，RNA再翻译出蛋白。所有细胞虽然基因相似，但依据它们的作用和收到的外界环境的信息，不同细胞在不同时刻只是发布特定命令。正常细胞中，这种过程以有组织的方式进行，但癌细胞中的RNA完全改变。胰腺癌（Pancreatic cancer，PC）是所有癌症中最难治愈的一种，当胰腺细胞转变为癌细胞时，它们放弃了正常的功能，开始发布加快分裂和入侵邻近组织的异常信息。

此次研究的目的是破译胰腺癌细胞转录的RNA，将这些RNA与正常胰腺细胞转录的RNA进行对比，寻找那些负责肿瘤生长和入侵的RNA及这些RNA翻译的蛋白。研究人员采集胰腺活检组织和健康胰腺样本，利用微列阵（或称DNA芯片）对这些样本的数千个基因转录的RNA进行定性和定量分析。

               

首先是提取样本的RNA，并进行荧光标记。RNA能够和与之互补的DNA结合。微列阵上排列有序的DNA片段能够检测人类基因组中将近3万个基因所转录的RNA。当RNA接触微列阵后，和与其互补的DNA结合，产生荧光信号。

第二步是对比肿瘤细胞和正常细胞的芯片荧光图像。好像“找茬（Spot the difference）” 游戏，研究人员寻找两张图像的不同之处。然而此次实验中的两张图的差异并不是游戏中的那么简单，需要对比密集点阵形成的复杂图像。结果，研究人员发现116个RNA在癌细胞中过量表达。

这些RNA可能是促进癌细胞快速生长、扩散和入侵其它组织的命令，它们和它们所编码的蛋白是治疗、诊断癌症的潜在靶标。（生物通 小粥）

Winner of the V. Thesis Prize on Basque Research website Author: Jokin del Amo (UPV/EHU)