有望降低DNA测序成本的新发现

最近，西北大学机械工程副教授Sandip Ghosal利用经典流体力学理论，阐明了DNA和纳米孔之间的相互作用，为实现单碱基纳米孔测序迈出了重要一步。详细信息将刊登于7月8日《Physical Review Letters》杂志。

　　

生物通报道：五月份，诺贝尔奖得主、DNA结构的发现者之一James D. Watson成为获得个人全基因组测序结果的第一人。测序过程前后长达两个月，总耗资1百万美元。1百万美元获得个人基因组图谱，对大多数人来说是承受不起的。因此，美国国立卫生研究院预计在2014年将其成本降到1000美元。

纳米孔测序是加速DNA测序、降低成本的候选方法之一，其中DNA如同穿过针头一样通过直径只有5－10纳米的微孔。这种技术能够检测单个DNA分子，但由于DNA穿过的速度太快，而阅读单个的碱基和测序。

西北大学机械工程副教授Sandip Ghosal利用经典流体力学理论，阐明了DNA和纳米孔之间的相互作用，为实现单碱基纳米孔测序迈出了重要一步。详细信息将刊登于7月8日《Physical Review Letters》杂志。

DNA被电场力拉入纳米孔通道，但还存在一个来自流体摩擦的阻力，能够减缓DNA的流速。DNA牵引周围的液体随其一起穿过通道，流体层出现的摩擦力形成了抵抗电场拉力的抗性，会减慢DNA的穿过速度。Ghosal在文章的结论中表示，他的理论模型和实验结果是一致。

弄清DNA流动的机制有助于研究人员设计出更多的增加摩擦力的方法。Ghosal正打算对通道内壁进行包被，降低DNA的流动速度。（生物通 小粥）