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530万美元经费用于水稻表观遗传研究
关键字:DNA甲基化|表观遗传学|水稻    www.ebiotrade.com  时间:2007年9月12日17:52    来源:生物通

生物通报道:水稻是世界最重要的一种粮食作物。利用一种新的“深度测序”技术,由特拉华州大学的研究人员领导的研究队伍将揭
示水稻的特定基因开启或关闭的位置、原因及机理。这种新的测序技术能够同时破译5000万个序列,即超过10亿个DNA碱基。

 

这项为期四年的研究计划的目标是深入了解水稻的表观基因组学。这项研究获得了美国国家科学基金会的530万美元的资助。最终,该研究可能培育出更加强壮的水稻,并且所揭示出的机理可能也在玉米和其他重要谷物中同样起作用。

 

特拉华州大学的植物和土壤学助理教授Blake Meyers是这项计划的首席研究员,该研究组还包括俄亥俄州大学的华裔生物学家王国梁(Guo-Liang Wang,音译)以及来自加州大学洛杉矶分校等研究机构的表观遗传学、计算机科学的专家。

 

这项研究是建立在Meyers之前主持的NSF基因组研究项目和正在进行的小RNA研究的基础之上的。这些研究项目为新研究提供了新的研究方向。

 

研究将使用由Solexa公司开发的先进的SBS(sequencing by synthesis)技术来获得研究项目的关键数据。这种新的“深度测序”工具能够一次解码数千万序列。

 

自从科学家破解了构成人类和动物基因组的碱基密码以来,研究人员正在研究基因功能的其他化学修饰层次,即表观遗传学。表观遗传学与基因序列本身一样重要,因为它控制基因是否被开启或关闭,从而决定它们是否制造蛋白质。

 

表观遗传学是与遗传学(genetic)相对应的概念。遗传学是指基于基因序列改变所致基因表达水平变化,如基因突变、基因杂合丢失和微卫星不稳定等;而表观遗传学则是指基于非基因序列改变所致基因表达水平变化,如DNA甲基化和染色质构象变化等;表观基因组学(epigenomics)则是在基因组水平上对表观遗传学改变的研究。

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