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1200万奖励给全基因组重测序
关键字:重测序|全基因组|resequence|1200万    www.ebiotrade.com  时间:2008年1月8日17:18    来源:生物通

生物通报道:来自纽约1月7号的消息,美国国立卫生研究院计划拿出1200万美元用于奖励在未来两年中,发展了全基因组医学研究中重测序(resequencing)
技术“线路(pipeline,生物通注)”的研究项目。

国立心脏、肺部和血液研究院,以及国家人类基因组研究院(National Human Genome Research Institute ,NHGRI)计划将这一奖励用于3至4个资助。

这项计划的目的是“通过在DNA靶标捕捉与测序领域中,组合目前已有的技术,发展出一种高效,低成本,高通量的全基因组范围内医学靶标的重新测序技术。”

重测序技术的应用主要目的在于“能以一种高校低成本的方式对NHLBI中表型良好(well-phenotyped,生物通注)的,成千上万的DNA眼皮序列进行测序”,这种方法能将基因组1%序列测定的成本降低到1000美元。

此次重测序项目的将聚焦在两万个蛋白编码基因组的外显子上,这些基因属于NCBI的Entrez Gene数据库中的RefSeq基因,除此之外,目的靶标还包括譬如miRNA和调控元件的其它功能蛋白。

测序技术自454 Life Sciences的新型基因组测序仪Genome Sequencer20(GS20,见[测序新产品]GS20 升级版)得到越来越多的应用之后获得了新的发展,7月1日的《Nature》提及了一种DNA测序新技术,绘制出胚胎干细胞(ES细胞)和来自ES细胞的两个细胞系的全基因组染色质图谱,并发现一组以染色质为基础的特殊代码。

虽然研究人员能够利用专门的DNA芯片确定位点,但对于绘制哺乳动物染色质全基因组图谱,则耗时且成本高。这种以单分子测序(single-molecule sequencing)为基础的新技术,能够同时阅读几十亿个碱基,轻而易举地计算出染色质结构的全基因组图谱,为揭开围绕染色质、表观遗传学和其它生物学事件的许多悬而未决的问题开启了一扇新的大门。

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