分析量增100倍的新PCR芯片分析系统

【字体: 时间:2008年01月10日 来源:生物通

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  美国匹兹堡大学医学院已经同意检测WaferGen公司的实时PCR系统和与该系统配套的癌症基因分析面板。

  

生物通报道:美国匹兹堡大学医学院已经同意检测WaferGen公司的实时PCR系统和与该系统配套的癌症基因分析面板。

 

据悉,这种SmartChip实时PCR系统是一种全基因组基因表达平台,将可能加速基因表达和基因分型的速度并有价格优势。

 

该系统能够在一个芯片上进行33750个分析,而标准的实时PCR技术每盘只能进行384个分析。也就是说,这个新的系统的分析量提高了近100倍。

 

匹兹堡大学医学院的研究人员打算使用该系统鉴定慢性阻塞性肺病和肺癌的生物标志物。另外,WaferGen还表示,他们目前正在开发该系统的其他分析用途,包括毒理分析。而且,他们还在开发改系统的一个高通量版本,从而希望能使使用者在一个芯片上进行100000个分析。这种能力将使使用者只使用一个芯片就能进行全基因组的基因表达。

 

此前,美国FDA(食品与药品监督管理局)批准Prodesse公司出售它们的以实时PCR为基础的流感检测技术。

 

该公司的ProFlu分析专门设计用于同时检测和区分A型流感病毒、B型流感病毒和呼吸道病毒,并且能够在大约三个小时内给出结果。

 

Prodesse公司表示,目前他们还在研制其他检测技术,包括对人类间质肺炎病毒(metapneumovirus)的检测方法。在临床上需要对这种病毒与副流感病毒进行区分,并且即将开始临床试验。

 

FDA在宣布同意推广Luminex公司的一种呼吸道病毒分析面板的同一周内宣布了这项消息。

 

Luminex公司的xTag呼吸道病毒面板(xTag Respiratory viral Panel)基于改公司的xMAP珠技术并且能够靶向12种病毒,而这12种病毒则能导致85%的呼吸道病毒感染(包括不同的流感病毒株)。

 

Prodesse宣布,它们的实时PCR检测具有多种优势,例如能够减少传递时间、消除扩增子载体污染和比其他分子诊断技术(包括微珠和芯片)相对较低的装备成本。(生物通雪花)

 

名词解释:

 

实时PCR

 

实时PCRreal—time  polymerase  chain  reaction)又称荧光定量PCRTaqMan  PCR,是美国PE公司(Perkin  Elmer)于1995年研制出的一种新的核酸定量技术。该技术在常规PCR基础上运用荧光能量传递(fluorescence  resonance  energy  transferFRET)技术,加入荧光标记探针,巧妙地把核算扩增、杂交、光谱分析和实时检测技术结合在一起,借助于荧光信号来检测PCR产物。一方面提高了灵敏度,另一方面还可以做到PCR每循环一次就收集一个数据,建立实时扩增曲线,准确地确定CT值,从而根据CT值确定起始DNA的拷贝数,做到真正意义上的DNA定量。另外由于CT值是一个完全客观的参数,CT值越小,模版DNA的起始拷贝数越小。因此,利用CT值确定DNA拷贝数实时PCR方法比普通终点定量方法更加准确。

实时荧光定量PCR要用定量PCR仪,常见的仪器有PE公司的PE系列,罗氏公司的Lightcycle系列,Robbett公司的RG系列。而根据荧光化学原理不同可分为DNA结合染色、TaqMan技术、Amplisensor、分子灯塔、复合探针法、杂交探针、自身谇灭技术等。目前,荧光定量PCR已被应用与病原体测定、免疫分析、肿瘤基因测定、基因表达、突变和多态性研究。

 

慢性阻塞性肺疾病

 

慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary diseaseCOPD) 一种具有气流受限特征的疾病。这种气流受限不完全可逆,呈进行性发展,与肺部对有害气体或有害颗粒的异常炎症反应有关。

COPD的症状包括咳嗽、咳痰及活动时气促,并常有这些症状急性加重,COPD与我们通常所说的慢性支气管炎和肺气肿密切相关。该病患病人数多,病死率高,由于其缓慢进行性发展,严重影响患者的劳动能力和生活质量。

 

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