中科院鉴定新的癌症易感基因

　　

近日，中科院上海生科院营养科学研究所的王慧研究组在中国汉族女性乳腺癌和PALB2基因多态性之间的关联研究取得新进展，其研究论文发表于Clinical Cancer Research。

 

PALB2是重要抑癌基因BRCA2向细胞核内的转移定位及核内稳定的协同因子，在保持基因组稳定和调节细胞周期过程中起重要作用。该基因发生突变能够引起2倍于正常人群的乳腺癌发病率。该项研究与南京医科大学沈洪兵教授研究组合作，采用病例-对照(Case-Control)的研究方法，在1049例病人和1073例对照中首次发现PALB2基因上3个SNP位点rs249954、rs120963和rs16940342和中国汉族女性乳腺癌的易感性相关。这为我国乳腺癌高危人群的筛选和预警提供了重要的理论依据。

 

原文摘要：Association of Common PALB2 Polymorphisms with Breast Cancer Risk: A Case-Control Study

 

【Abstract】

Purpose: The PALB2 gene has an essential role in BRCA2-mediated DNA double-strand break repair and intra–S phase DNA damage checkpoint control, and its mutations are moderately associated with breast cancer susceptibility. This study was designed to investigate the common variants of PALB2 and their association with breast cancer risk.

 

Experimental Design: Four single nucleotide polymorphisms (SNP; rs249954, rs249935, rs120963, and rs16940342) which tagged all 19 of the reported SNPs (minor allele frequency >0.05) covering PALB2 were selected and genotyped in 1,049 patients with breast cancer and 1,073 cancer-free controls in a female Chinese population.

 

Results: Based on the multiple hypothesis testing with the Benjamini-Hochberg method, tagging SNPs (tSNP) rs249954, rs120963, and rs16940342 were found to be associated with an increase of breast cancer risk (false discovery rate–adjusted P values of 0.004, 0.028, and 0.049, respectively) under the dominant model. tSNP rs249954 was associated with a 36% increase of breast cancer risk [adjusted odds ratio (OR), 1.36; 95% confidence intervals (CI), 1.13-1.64; P = 0.001; TT/TC versus CC genotypes]. The adjusted OR for rs120963 was 1.25 (95% CI, 1.04-1.49; P = 0.014; CC/CT versus TT genotypes). For rs16940342, the adjusted OR was 1.21 (95% CI, 1.02-1.45; P = 0.037; GG/GA versus AA genotypes). Based on an additive model, tSNPs rs249954 and rs120963 were associated with an increase of breast cancer risk (P = 0.005 and 0.019; respectively), with the false discovery rate–adjusted P values being 0.020 and 0.038, respectively.

 

Conclusions: Our data suggest that the variants of PALB2 confer low-penetrance breast cancer susceptibility in a Chinese population.

 

附：

王慧个人简介

博士，研究员，博士生导师。1999年在天津医科大学/美国伯明翰阿拉巴马大学(UAB)获得医学、理学博士学位(中美联合培养)；1999年至2001年在UAB大学做博士后研究；2001年至2002年任UAB大学临床药理学、药理与毒理学讲师；2002年至2005年任助理教授、UAB癌症研究中心副研究员及医学院癌症药理学中心实验室副主任；2005年10月至今任中国科学院上海生科院营养所研究员、研究组长(PI)、食品安全研究中心主任、复旦大学兼职教授。申请人长期从事肿瘤信号转导通路及肿瘤预防治疗、人群基因易感性及早期诊断、环境有毒物质作用机制及其快速检测技术研发，在新药的药理和毒理评价领域具有丰富经验，在疾病预防控制、早期诊断及靶向治疗的基础和应用研究中成绩突出，重视学科交叉渗透及多学科综合研究，是2000年美国临床药理和药物学会理事长奖和2000年国际肿瘤预防学会青年学者奖获得者。至今，在PNAS、Cancer Res、JBC、Oncogene、Clin Cancer Res、Mol Cancer Ther 等国际期刊上发表研究论文72篇（其中SCI收录论文56篇、被引用907次），参编书籍3部；国际学术会议大会邀请报告2次；申请国内外专利5项（美国3项、中国2项）；为国际期刊Cancer Res、Clin Cancer Res、Mol Cancer Ther 等的审稿人，为美国国立卫生院癌症研究所(NCI)提交20多个用于新药开发的保密性总结报告；为美国癌症研究协会（AACR）和中国细胞生物学学会（CSCB）和中国生物化学与分子生物学学会（CSBMB）会员；申请国内外专利5项。2006年入选上海市“浦江人才计划”；2007年入选中国科学院“****”，获教育部留学回国人员科研启动基金，上海市科委“白玉兰计划”资助，并获得上海市优秀女青年科技工作者成才资助金。目前承担科技部重大科学研究计划项目及上海市科委重大攻关项目，同时还与政府、企业合作，承担多项药品、保健品、功能性食品以及食品安全检测开发项目。

所系名称 营养科学研究所
性别 女
专业名称 生物化学与分子生物学
Mail地址 [e-mail]


研究方向 分子营养药学与毒理学

研究工作 营养药学、应用药学、药物遗传学、基因组学及代谢组学的研究；原癌基因的调控与沉默－机制的研究及其在新药研发中的应用；基于RNA/DNA的生物工程－高新技术及其在新药研发中的应用；肿瘤微环境与机体相互作用机制的研究及其在新药研发中的应用；新型癌症早期检测手段的研究与应用；新型肿瘤免疫调节剂的研究与应用；天然产物中肿瘤治疗与预防性药物的研究与应用；肿瘤分子流行病学的研究；胚胎早期发育的分子调控；食品安全快速检测新技术、新方法的研究与开发；食品中有毒有害物质危害作用机制的研究。

获奖情况

1) 入选中国科学院“****”称号(2007)。
2) 获上海市优秀女青年科技工作者成才资助金 (2007)。
3) 中国营养学会年会优秀论文奖 (2006)。
4) 获美国临床药理和药物学会理事长奖(American Society of Clinical
Pharmacology and Therapeutics，ASCPT)，并被邀请作大会发言 (2000)。
5) 被提名为UAB国际学者奖最终候选人(2000)。
6) 国际肿瘤预防学会 (International Society of Preventive Oncology，ISPO) 青年学
者奖获得者，并在该学会举办的瑞士日内瓦年会上获得优秀论文奖 (2000)。
7) 被录入国际专业人士名人录 (2000)。
8) 天津市科技成果一等奖 (排名第一) (1999)。