
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
Genome Res:基因调控新成果
【字体: 大 中 小 】 时间:2008年12月03日 来源:生物通
编辑推荐:
生物通报道,来自宾夕法尼亚大学生命科学院比较基因组学与生物信息学系,生化与分子生物学系等机构的科学家在基因调控的研究方面取得新进展,相关成果公布在冷泉港出版社旗下的Genome Research上(目前影响因子11.4)。
基因表达的调控无疑是科学家们研究的热点课题,因为基因调控决定着机体的表观遗传特性,比如说组织的形态以及组织器官的功能等等,这些都依赖于基因的表达调控。最近,关于基因表达调控存在着很大的争议,争论的焦点为是否控制基因表达的基因组信号受强大的选择性限制作用。有些研究人员认为,非编码区域受高度的限制,它们具有加强转录的能力;其他的研究者又认为,哺乳动物进化的过程中具有调节功能的DNA片段区域是不受严格限制的。
为了检验这两种可能性,研究小组用染色质免疫沉淀法来检验,研究者选取小鼠第七号染色体上的66-Mb区域,这个区域受红细胞系统转录子GATA1调控。通过杂交的方法找出有GATA1的区域,用定量PCR进行鉴定并检验红细胞的基因调控活性情况。
GATA1是被认为具有调节基因表达功能的蛋白质,科学家就是要通过对GATA1的研究证实基因表达是否受选择性限制,GATA1是否只对特定区域的基因有调控作用还是对不具有选择性。
研究者分离获得约63个含有GATA1调控的片段,这些片段都具有WGATA1结合位点,其中45%的序列处于高度保守的状况。其他的哺乳动物同样具有GATA1结合位点。
为了证实GATA1是否具有促进基因表达的能力,研究者从小鼠基因组上切下GATA片段,并将这些片段插入小鼠红细胞中,在红细胞中观察基因的表达活性。结果发现,52%的基因活性增强了2倍,28%的基因活性增强了3倍。
这些研究结果表明,GATA1结合片段具有高度促进基因表达的活性,并且GATA1的片段在进化上也高度保守。红细胞成熟的过程中,GATA1是控制基因表达活性的关键因子。