哈佛大学免费提供研究蛋白定位的网络工具

哈佛大学最近宣布开放一系列网络工具，供科学家研究蛋白质在细胞内不同组分中的定位（亚细胞定位）。利用这项免费的服务，人们可以很容易获得理想的、准确地高的预测结果。这将会给在分子细胞生物学、蛋白组学和药物研究带来便利。

　　生物通报道：在分子细胞生物学、蛋白组学和药物研究中，蛋白质的亚细胞定位信息是非常重要的，因为蛋白质在细胞内不同组分中的定位，对其生理功能有直接的影响。为了给这些领域的科学家提供一个界面友好的工具，哈佛大学在1月17日的《Nature Protocols 》上宣布开放一系列服务器，供科学家免费使用。

这些服务器的程序采用“高层次”杂交的方法从头计算，以预测蛋白质的亚细胞定位。这套系统被称为Cell-PLoc，包括下列6个预测程序包：Euk-mPLoc、Hum-mPLoc、Plant-PLoc、Gpos-PLoc、Gneg- PLoc和 Virus-PLoc，分别用于预测真核细胞、人体、植物、革兰氏阳性细菌，革兰氏阴性细菌和病毒蛋白质的亚细胞定位。

利用这些网络服务器，人们可以很容易获得理想的预测结果，具有较高预期的准确度。进行多达22个亚细胞定位的位点一系列的交叉验证测试，结果证明，没有一个蛋白质与亚细胞定位相同的其它蛋白质有大于25%的序列同源性。

这些网络服务器也可以用来处理那些多样的蛋白质，这些蛋白质同时存在，或在两个或两个以上位点间移动。能够定位在两个或两个以上不同的亚细胞位置的蛋白，特别让人感兴趣，因为这往往意味着某种特定的生物学功能。

哈佛的科学家表示，这些网络服务器的响应非常快速，在绝大部分情况下，预测的时间小于5秒。

要使用该服务，只需点击进入http://chou.med.harvard.edu/bioinf/Cell-PLoc/并按照说明操作使用即可。
（生物通，揭鹰）