10分钟分析50万DNA序列的新软件

　　

生物通报道：全世界的科学家花费了约5亿美元和13年的时间鉴定出人类基因组的超过35000个基因。就在五年后，美国波士顿的生物学家Gabor Marth和他的研究组开发出能够在10分钟分析50万个DNA序列的软件。

 

Marth的实验室拥有专利权的这种叫做PyroBayes的然间是一种新的计算机程序，能够精确处理最新的基因解码机器产生的大量基因组数据，从而致使计算机在数据加工领域的提速和精确度的增加。

 

研究人员表示，他们开发的新软件将有助于了解人类疾病的遗传病因以及遗传物质如何觉得动物特征。

 

PyroBayes将会帮助千人基因组计划的研究人员提速研究。美国NIH已经向Marth资助130万美元，在接下来的四年来继续开发处理软件。

 

近期基因组研究动态

 

国际大熊猫基因组计划：由中国科学家发起，加拿大、英国、美国、丹麦等国科学家联合参与的国际“大熊猫基因组研究”项目于3月6日正式启动。

该项目由来自深圳华大基因研究院、中国科学院昆明动物研究所、中国科学院动物研究所、成都大熊猫繁育研究基地、中国保护大熊猫研究中心以及其他国内外的科学家共同发起并承担，得到了政府和企业的大力支持。这一计划的近期目标是在半年之内，完成大熊猫基因组的序列框架图。

日前，该研究项目有了新进展：目前科学家正在对大熊猫“晶晶”进行基因组测序，相信在北京奥运会开幕之前就可以完成世界上首例大熊猫基因组的框架图。

分析人类胚胎干细胞基因组

来自美国加州大学洛杉矶分校的干细胞研究人员利用一种高分辨率技术分析了两个人类胚胎干细胞系的基因组，并且发现尽管两个细胞系都能形成神经元，但是两个细胞系在特定基因德数量上有差异。这些特定的基因能控制个体特征和疾病敏感性。

 用于研究这个基因组的技术叫做CGH芯片。这种较高分辨率的技术的使用，将会提高研究人员分析干细胞系的能力，从而确定出最可能导致疾病和其他问题的基因病并最终有助于找到治疗人类疾病的方法。这项研究的结果发表在3月27日的《Stem Cell》杂志上。

CGH芯片（Array CGH）能够更好地分析人类胚胎干细胞的染色体基因成分，其分辨率是标准临床方法的100倍。临床专家通过产生一种染色体组型来分析癌细胞的染色体，其精确度要比Array CGH低很多。但失之毫厘，谬以千里，很小的缺陷都可能导致之后很大的问题。

 这项新研究表明，单个人类胚胎干细胞系的遗传组成，其在可能控制特征和疾病敏感性等的相关基因的拷贝数量上都有所差异。因此，研究人员指出，选择用于治疗的干细胞系时，需要知道这些差异才不至于选上可能导致患者出现问题的细胞系。（生物通雪花）