新芯片技术揭示干细胞MicroRNA模式

【字体: 时间:2008年04月15日 来源:生物通

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  一项以新芯片为基础的方法正在被用于鉴定人类胚胎干细胞的特定microRNA模式。包括来自Scripps研究所和美国圣地亚哥Illumina公司的研究人员组成的国际研究组利用一种类似Illumina的DASL基因表达分析方法比较了十多个干细胞系和几种其它细胞类型。研究的结果刊登在近日的《Stem Cell》杂志的网络版上。

  

生物通报道:一项以新芯片为基础的方法正在被用于鉴定人类胚胎干细胞的特定microRNA模式。

 

包括来自Scripps研究所和美国圣地亚哥Illumina公司的研究人员组成的国际研究组利用一种类似Illumina的DASL基因表达分析方法比较了十多个干细胞系和几种其它细胞类型。研究的结果刊登在近日的《Stem Cell》杂志的网络版上。

 

文章的同学作者Jeanne Loring表示,他们公布了人类胚胎干细胞迄今最全面的microRNA表达分析结果以及microRNA的细节差异,而这种差异可能是调节干细胞多功能性的关键。

 

为了分析使人类胚胎干细胞具有这种多功能性的分子调节过程,Loring和她的研究组集中研究了microRNA。

 

当然这不是鉴定miRNA在干细胞中作用的首次研究。之前在小鼠中进行的研究显示,miRNA可能促进干细胞自我更新和分化的能力。Loring等人指出,2007年的一项研究对老鼠干细胞中超过30万个miRNA克隆进行了测序研究。诞生,他们表示,之前研究使用的实验设计和研究工具使这些研究很难就干细胞中miRNA的表达给出准确结论。

 

miRNA的独特生物学特性以及检测和定量这些小RNA的方法的局限性使研究人员很难了解它们在高等动物中的功能。

 

在这篇新论文中,研究人员使用了一种新的芯片方法,使他们迅速地检测了26个不同细胞类型中miRNA的含量和表达情况。这种技术对Illumina的高通量基因表达分析、cDNA介导的退火、筛选、延伸和Ligation分析进行了改良。

 

研究组利用700个与来自2006年Sanger数据库的397个已标注人类miRNA序列和303个在人类和黑猩猩大脑样本中发现的人类miRNA序列相对应的分析探针。

 

当他们比较人类胚胎干细胞和其它细胞类型的miRNA表达时,Loring的研究组发现有150个miRNA在干细胞中的表达水平有所不同,并且聚集在染色体的某区域,其中76个的表达被上调,而74个在干细胞中被下调。

 

引人注意的是,几种与癌症有关的miRNA在干细胞中高度表达。另一方面,已知与癌症抑制有关的miRNA似乎在胚胎干细胞中相对较少见。

 

研究人员还根据miRNA在空间聚集和表达模式以及miRNA潜在靶标mRNA和靶标序列,对这些细胞系进行了分类。

 

研究人员表示,这些发现延伸了我们的知识,并且揭示出miRNA在调节细胞多功能性和自我更能方面的潜在作用。研究人员总结说,miRNA分析能够用于分类不同细胞类型,并且人类胚胎干细胞拥有一种独特的miRNA标签。这些结果意味着有可能揭示出不同miRNA在干细胞维持和分化中的功能。(生物通雪花)

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