《科学》:学科交叉拓展基因组学研究

【字体: 时间:2008年04月28日 来源:生物通

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  在本期《科学》杂志上发表的两篇文章突出了多学科合作研究在了解从基因型和显型到群落生态的所有信息方面的重要性。

  

生物通报道:在本期《科学》杂志上发表的两篇文章突出了多学科合作研究在了解从基因型和表型到群落生态的所有信息方面的重要性。

 

在第一篇文章中,来自美国北亚利桑那州大学、西弗吉尼亚大学和田纳西州大学的研究人员对生态系统遗传学(基因组在一个生态系统中的相互作用方式)进行了研究。他们提出,生态学和基因组学应该被整合在一起来分析,从而使研究人员能够在遗传和基因组信息基础上了解群落和生态系统。

 

研究人员表示,通过阐明与群落遗传和生态系统显型有关的特定基因、等位基因和表观遗传机制,基因组学观点能够进一步促进我们对群落结构和生态系统过程的了解。

 

群落和生态系统中有数百、数千物种相互作用,这些物种之间的关系能够对群落一种或更多物种产生一种选择压力。这意味着实验室中的基因组学研究可能无法完全解释真实世界的基因组。这也意味着群落和生态系统能够具有可遗传特征。

 

研究人员指出,由于群落中,并不是所有的基础物种都被作为模式生物加以研究,因此研究人员呼吁对非模式基础物种进行更多的遗传和基因组研究,从而促进遗传群落和生态系统的研究。

 

第二篇《科学》文章强调了交叉学科研究的重要性。杜克大学的生物学家Philip Benfey和Tomas Mitchell-Olds叙述了将基因型翻译表型有关的挑战。Benfey表示,要想实现成功的“翻译”就需要系统生物学和群体遗传/进化生物学两个领域的合作。

 

这是因为,与旧的平行研究方向观点不同,大多数基因似乎都在复杂的网络中起作用。Benfey等人认为,研究人员需要在将基因型与表型联系在一起时考虑到所有这些网络。

 

系统生物学工具和方法是一种能够覆盖不同类型信息的方法,从而了解这些网络中的表型效应。例如,遗传学家能够通过分析完全的基因组序列而必分析特定SNP能获得水平完全不同的信息。

 

另外,Benfey指出,不同类型(不同水平上)的信息根据所研究的问题尤其会比较突出。随着研究人员的研究目标从细胞和组织转移到个体、群体和生态系统,其复杂性也进一步升级,从而迫使基因组学和其它生物领域研究方法的整合。Benfey指出,这是生物学面临的一个挑战。(生物通雪花)
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