科学家修订“Y染色体树”

　　

生物通报道：一个科学研究组日前宣布说完成了Y染色体单倍群树（Y chromosome haplogroup tree）的一个新的修订版，包含了来自数百个之前未囊括的遗传标记。

 

来自美国亚利桑那州大学和斯坦福大学的研究人员利用5年的时间首次改写了Y染色体单倍群树，通过整合近600个新遗传标记创造了20个分支中的超过300个修订单倍群组。

 

这项研究的成果发表在近日的《Genome Research》杂志上，该文章描述了这些重组和它们在将来评估Y染色体多态性方面的应用潜力。

 

Y染色体是从父亲传递给儿子的性染色体。由于它含有不随时间而变化的保守区域，因此Y染色体对确定人类历史和血统很有用。对Y染色体上的遗传变异进行分析能够有助于家谱和进化生物学的研究。

 

第一个Y染色体进化树在2002年完成。这个叫做Y染色体协会树（Y Chromosome Consortium tree）的进化树包含了基于243各遗传标记的153个单倍群。修订版的进化树将于明年公布。

 

在研究期间，越来越多的Y染色体多态性在SNP研究、前测序计划和其他研究中被鉴定出来。因此，研究人员对不同Y染色体单倍群组之间的关系的认识也在发生着变化。

 

该文章的主要作者Michael Hammer指出，SNP的发现率在过去几年里持续增加，而有关Y染色体区域和亲和性的发现也持续增加。尽管这些新信息很有价值，但讽刺的是这些新信息也给这个领域引入了一定的混乱。

 

这项新研究的目的是想弄清这些“混乱”。Hammer和他的同事增加了586个新的突变和13个循环突变，从而扩充和重排了这个“树”。这种校正也对一些分支等进行了修订。

 

这个新的“树”还给出了有关不同分支共享一个共同祖先的时间的新估计，并且表明一些群体要比之前认为的更古老或更年轻。与之前的估计相比，旧的估计是建立在卫星变异基础之上的，而新的估计则依赖于SNP数据并对群体历史或人口统计没有事先假定。

 

即使如此，研究人员表示，仍然还有一些已知的突变需要整合到这个新“树”中去。而且，随着测序费用和SNP类型的减少，将来还会产生更多的数据。

 

在文章的最后，研究人员呼吁增加能够有机会接触到具有已知Y染色体多态性的细胞系来促进将来Y染色体的研究。（生物通雪花）