454新一代测序技术用于农作物SNP检测[创新技巧]

【字体: 时间:2008年06月05日 来源:生物通

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生物通报道——Roche旗下的454生命科学今天宣布将与Cogenics®(Clinical Data的子公司)及Limagrain Verneuil Holding(LVH)合作,共同开发解决方案,以便开展大规模农作物SNP检测计划。Limagrain想要通过对优良性状的选择和杂交育种,来改善某种饲料作物。利用新一代的454测序技术,Cogenics和454生命科学将提供一种解决方案,来探索用于选择的遗传变异。首个大规模应用将针对小麦进行,接下来会有其他的作物。

Cogenics将开发一种减低基因组复杂度的实验,方法是在多个变异体的基因组中选择一个基因丰度相同的区段。Cogenics将与454密切配合,通过Genome Sequencer FLX系统来对2Gb的小麦基因组进行测序。

对于鉴定与优良性状相关的分子标记物的过程来说,这是首个也是关键的阶段,它将由Cogenics在法国的一个部门来完成。第二阶段需要大规模的基因分型,将由Limagrain来完成。通过这个途径,能显著加速新变异体中优良性状的组合。

Cogenics欧洲管理层负责人Paul Tomlin表示:“自2007年春 Cogenics购置了新一代的454系统以来,它已经为很多科研人员、生物公司和工业客户提供了服务。这些客户信赖Cogenics,是因为它提供了有价值的服务,尤其是结合了额外的上游和下游的处理性能。Cogenics已经利用新一代的454系统与自身基因组学服务和信息学的能力结合起来,完成了细菌基因组、cDNA、BAC、小分子RNA、环境基因组学和人类突变探索等项目。”

LVH基因分型中心领导Jean-Pierre Martinant认为:“Limagrain在基因分型方面已有多年经验,并拥有领先的技术。我们很高兴与Cogenics一起开展新一代测序,相信这个方法能显著增加我们大规模基因分型的能力,以满足这个计划的目标。这个计划将深化我们带给客户的价值,我们与Cogenics合作也是因为他们在这个领域的专业技能。”

关于454测序的详细信息,请访问:www.roche-applied-science.com/sis/sequencing
(生物通 余亮)

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