获得流产布鲁氏菌S19全基因组序列有助找出毒力基因

　　

维吉尼亚技术中心生物信息学研究所、爱荷华州国立动物疾病中心和康涅狄格州布兰福德454生命科学研究所的研究者合作，已经获得流产布鲁氏菌S19株的基因组序列。S19是John Buck医生1923年发现的流产布鲁氏菌，无致病性。近60年以来，S19都用于制备疫苗保护牛群免受其他布鲁氏菌的攻击，布鲁氏菌能引发引起家畜生殖障碍的传染病。

科学家们长久以来都希望了解S19的基因组信息，是怎样的遗传特性使得S19可以作为疫苗保护牛群，找出了这种遗传特性就能找到其他布鲁氏菌导致流产的秘密。研究者通过对新获得的S19基因组信息和先前获得的两株布鲁氏菌的基因组进行比对，发现包含24个基因的基因群与布鲁氏菌的毒力相关。以“布鲁氏菌疫苗S19基因组与毒力株基因组比对发现可能的毒力基因”为题，发表在5月的PLoS上。

Oswald Crasta（VBI's Cyberinfrastructure Group 项目主任，文章的通讯作者）说，我们可以在Roche的GS-20™ 和 GS-FLX™平台上快速的获得S19的基因组序列，并在小范围内与其他基因组群比对寻找布鲁氏的毒力基因。将S19的全基因组与另外两个有毒力的布鲁氏菌全基因组进行比对发现，有4个基因可能是与毒力相关的。他还说，我们将对细胞内脂质转运、蛋白转运和代谢机制的特点进行深入的研究。我们相信对这些特点的了解可以解释，为何这么多年来S19是如此成功的疫苗候选株，为何其他的菌株具有致病性。

前期序列测定在454生命科学研究所用Roche的GS-20™进行，随后的在VBI的核心实验室中用Roche GS-FLX™测序。额外的传统的测序法在VBI的核心实验室中完成，至此S19的基因组序列测定完毕。Clive EvansVBI实验室的副主任说，S19的序列是VBI实验室用Roche GS-FLX™绘制的首个细菌全基因组序列，这台仪器在2007年1月安装使用。

VBI的负责人Bruno Sobral说，S19全基因组序列的测定帮助我们了解布鲁氏菌的分子致病机制。他还说，布鲁氏菌能从动物身上传播至人身上，对人畜的公共安全产生影响。布鲁氏菌还是农业、军事研究的对象。我们的研究能帮助了解不同布鲁氏均的遗传背景。

（生物通 张欢）