《自然》《细胞》两张重要图谱

【字体: 时间:2008年07月28日 来源:生物通

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  来自欧洲分子生物学实验室EMBL的研究人员在第一篇文章中获得了一项里程碑式的成果:完成了酿酒酵母所有重组产物的高分辨率分布图。

  

生物通报道:来自欧洲分子生物学实验室EMBL的研究人员在第一篇文章中获得了一项里程碑式的成果:完成了酿酒酵母所有重组产物的高分辨率分布图。

减数分裂重组在性别区分生物的进化过程中扮演着十分关键的角色,在减数分裂过程中,细胞分裂形成生殖配子,来自每个子染色单体的DNA链交换伙伴。这种交换会得到两种结果:交叉重组(Crossovers)与非交叉重组(Non-crossovers),这两种重组方式可以增加遗传的多样性,但是由于基因的转换可能会出现均化等位基因(homogenize alleles )。

Crossovers在基因组中出现得很多,而Non-crossovers,以及基因转换则只是在少数位点被确认,并且Crossovers在整个基因组范围内的分布以前被测定过了,但关于Non-crossovers分布的数据却因在侧翼标记没有被交换时识别重组的DNA有困难而缺乏。因此在这篇文章中,研究人员利用对56个酿酒酵母减数分离过程中获得的4种产物进行遗传标记获得的数据进行分析,获得了酿酒酵母所有重组产物的高分辨率分布图。这一里程碑式的分布图显示,存在特定于Crossovers和 特定于Non-crossovers的热点。

在第二篇文章中,来自加州大学细胞与发育生物学系,霍德华休斯医学院等处的研究人员发展了一种用于分析DNA甲基化和基因表达的数据的网络工具,绘制出了模式植物拟南芥全基因组甲基化图谱,这是第一张全基因组甲基化图谱,为研究转位沉默,表观遗传等提供了重要信息。

在这篇文章中,Zhang等人报告了第一张全面的基因组DNA甲基化图谱(35bp resolution)——拟南芥全基因组甲基化图谱,通过绘制这张图谱,研究人员发现在pericentromeric (基因组结构中迅速改变的区域)异染色质,重复序列,以及生成小干扰RNAs的区域都有大量的甲基化现象。


而且令研究人员吃惊的是,转录区域三分之一以上的表达基因都出现了甲基化现象,但是在启动子区域只有至多5%的基因有甲基化。有趣的是,在转录区域基因的甲基化有极大程度的组织特异性。除此之外,研究人员通过DNA甲基化酶null mutants全基因组tiling-array转录分析识别了成百上千的基因和intergenic noncoding RNAs,研究人员认为其中许多也许是通过DNA甲基化进行表观遗传调控的。

原文摘要:
Nature 454, 479-485 (24 July 2008) |
doi:10.1038/nature07135; Received 10 March 2008; Accepted 30 May 2008; Published online 9 July 2008
High-resolution mapping of meiotic crossovers and non-crossovers in yeast

Cell, 126:1189-201, 2006
Genome-wide high-resolution mapping and functional analysis of DNA methylation in Arabidopsis,"

 

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