《自然》及子刊发布两个基因组测序结果

【字体: 时间:2008年07月30日 来源:生物通

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  随着测序技术的更新与成长(见Nature:根除伤寒沙门氏菌指日可待),基因组测序已经不再成为许多研究的“拦路虎”,近期又有两项重要的测序结果公布

  

生物通综合:随着测序技术的更新与成长(见Nature:根除伤寒沙门氏菌指日可待),基因组测序已经不再成为许多研究的“拦路虎”,近期又有两项重要的测序结果公布。

《自然》杂志日前发表了由14个国家的64个科研小组联合完成的首个甲虫基因组的测序结果。研究结果表明,该甲虫基因组包括大约2亿个核苷酸,基因数量约为1.6万个。这一新的测序结果将有助于人们更好地理解甲虫的生物学机制,保护生物多样性。

这种甲虫的中文名称是赤拟谷道(red flour beetle),拉丁文学名Tribolium castaneum。由14个国家的64个科研小组组成的国际研究团队对赤拟谷道进行了完整的基因测序。研究结果表明,该甲虫基因组包括大约2亿个核苷酸,基因数量(包括蛋白编码基因及其他基因)大约为1.6万个。完成全基因组序列测序,有助于理解甲虫种类的生物学机制;同时可以预见,赤拟谷道也将会像果蝇一样,成为甲虫研究或生物学中的首选模型动物。

在很多人印象里,甲虫大多是害虫,其实在1万个甲虫种类里,只有很少几种是害虫,其余的既无害也无利,它们在维持生态系统、保护生物物种资源和生物基因库等方面发挥着重要作用,有些尚不被人们所认知。人类在开始认识生物的时候,就开始研究甲虫了。法布尔的《昆虫记》里有很多关于甲虫的描述,《本草纲目》等中医古籍中也有相当多的用甲虫开发的中药的记载。如毒隐翅虫含有毒隐翅虫素;斑蝥也是一种中药,开发历史由来已久。甲虫还是珍贵的科普教材,有很多甲虫很漂亮,有非常精致的外形和色彩。在日本,很多中学生都喜欢收集和研究漂亮的甲虫标本。

甲虫最重要的作用是维持生态平衡。甲虫广泛分布在森林、沙漠、雪山、高山、农田、海洋,它们的习性多样,哺食、寄生、直食等五花八门,这些都可以被人类加以利用。例如,澳大利亚引进牧业之后,家畜粪便破坏了草原环境,他们引进了俗称屎壳郎的粪金龟,使草原生态系统得到改善。

甲虫的适应性很强,它们甚至可以在哺乳动物的皮毛里寄生,还能在水里游泳。利用甲虫所处的环境的变化,人们可以研究环境变化对甲虫物种组成的影响,称作生物或环境指示生物。物种的组成可以反映出环境的变化,当我们要研究森林退化和沙漠化、全球变化温度升高、环境污染等一系列问题时,如何判断环境的改变,通过一些物理和化学指标还是很难来客观衡量的,环境的改善更应该通过保护环境的生物和生物多样性来衡量。

在最新一期英国《自然-生物工艺学》杂志网络版上,一个由法国、英国、美国和意大利等国研究人员组成的小组已成功破解了一种线虫的基因组。据专家介绍,这一成果将有助于了解对农作物有害的同类寄生虫的遗传机制,并有望以此为基础开发灭虫的新方法。

参与研究的法国国家农艺研究所28日发表公报说,目前人们已知的线虫种类大约有2.5万种,它们绝大多数存在于土壤中,寄生在植物根部,影响寄主植物的正常生长,并最终导致植物死亡。全球每年有大量农作物受到线虫寄生的影响,由此造成的经济损失达数百亿欧元。目前消灭线虫的常用方法是喷洒农药,但由于农药具有一定毒性,会对人体健康产生影响,因此寻找替代方案成为当务之急。

公报说,研究人员这次破解了一种名为根结线虫的基因组。对基因组的分析表明,根结线虫基因的特性与细菌十分相似,这也说明两者之间可能存在着“基因转移”现象,因为这可能有利于根结线虫在植物上的寄生。

研究负责人皮埃尔·阿巴德说,根结线虫具有极强的生命力和适应性,新研究成果将会帮助人们从遗传角度了解这些特性。

 

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