哈佛构建癌症基因表达谱

【字体: 时间:2008年08月21日 来源:Genome Biology

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新的系统分析法揭示癌症生成与转录子间的相互关系,这可能为癌症基因的表达提供新的视点。研究者将相关的文章发表在开放的BioMed 中心《Genome Biology》期刊上,研究者根据癌症发展的三个不同特征可将癌症分为三种不同的类型。

  

新的系统分析法揭示癌症生成与转录子间的相互关系,这可能为癌症基因的表达提供新的视点。研究者将相关的文章发表在开放的BioMed 中心《Genome Biology》期刊上,研究者根据癌症发展的三个不同特征可将癌症分为三种不同的类型。

 

美国波士顿儿童医院和哈佛大学的Isaac S Kohane领导一组研究人员开展相关的研究,他们在癌症早期比较不同基因在不同的人类组织里的表达情况,并且比较这些基因在不同癌症中的表达情况。他说,我们揭示了这些基因在各种癌症上的表达差异,并且根据这些表达差异数据构建了一个癌症参考数据库。

 

三组不同的癌症中的第一种癌症干细胞具有不同的发育特征,基因表达特征也不一样。从发育的角度来看,这一组癌症表现的特征是相似的。第二种类型的癌症,前期特征具有差异性,后期发育特征相似,并且具有炎症特征。第三种癌症组是一个癌症种类较少的组,以扩散性为癌症的特征。

据Kohane说,通过基因表达谱来区分癌症类型是惊人的发现。很明显的是,提供这些癌症的遗传背景数据为大规模分析癌症基因表达提供便利。

 

高通量的数据分析为研究人类疾病提供了大量的数据。据作者说,将注意力从单个疾病基因变异上转移到大量的基因表达模式上,有利于我们研究各种疾病与基因表达间的关联,并能预测可能出现的新型疾病类型。

 

关于这三类癌症类型的详细资料,请登陆Genome Biology (www.genomebiology.com)检索以下文章:

Analysis of gene expression in a developmental context emphasizes distinct biological leitmotifs in human cancers
Naxerova K, Bult CJ, Peaston A, Fancher K, Knowles BB, Kasif S, Kohane IS Genome Biology 2008, 9:R108
http://genomebiology.com/2008/9/7/R108

 

(生物通 张欢)

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