纳米孔测序技术再获NHGRI两项资助

　　

本月中旬，美国国家人类基因组研究所（NHGRI）宣布来自哈佛大学和加州大学圣克鲁兹分校（UCSC）的科学家分别获得千元基因组测序开发项目的第二轮资助，以进行纳米孔技术的研究。HNGRI的项目支持多项技术的开发，目的是让人类基因组的测序费用降至1000美元以下。到目前为止，NHGRI在千元基因组计划上的资助已超过2000万美元。

这两个研究小组都与英国的DNA测序公司Oxford Nanopore合作。UCSC的Mark Akeson和 David Deamer教授获得110万美元的资助，以测量电压和其他变量对纳米孔测序效率的影响。哈佛大学物理系教授Jene Golovchenko获得74.5万美元的资助，来开发利用纳米孔技术的测序平台，以满足NHGRI高效、廉价、快速的基因组测序目标。首轮他已获得650万美元的资助。

在2008年，Oxford Nanopore与哈佛和UCSC签署了协议，获得这两个小组所开发的纳米孔传感方法的独家授权。作为回报，Oxford Nanopore也同意资助这两个研究所的进一步研究。

根据加州大学圣克鲁兹分校的报道，纳米孔的最窄点仅为1.5 nm宽，刚好够单链的DNA分子穿过。在DNA穿过孔时，测量装置分析DNA链的结构与动力学。

Akeson表示他们正将DNA聚合酶与纳米孔配合起来研究，以控制DNA链穿过纳米孔的速度。一般来说，DNA链会以很快的速度跨膜。然而，Akeson和Deamer想方设法利用DNA聚合酶来减速，以便分析更长的DNA片段。

据悉，哈佛大学的Golovchenko的小组也将利用这74.5万元继续开发“固态”纳米孔的测序技术。此项技术有望进一步改善生产成本和测序性能。

Oxford Nanopore的纳米孔测序仪还尚未有推出的时间表，但有可能是第三代测序技术当中最便宜的。纳米孔测序的优势在于它不需要对DNA进行标记，也就省去了昂贵的荧光试剂和CCD照相机。（生物通 余亮）