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罗氏454即将推出新的测序仪[新品推荐]

【字体: 时间:2009年11月23日 来源:生物通

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  为了满足日益增长的新一代测序需求,罗氏旗下的454生命科学公司近日宣布将在2010年推出新的普及型测序平台-GS Junior System。新仪器的大小与普通的激光打印机差不多,它的性能和特征会更适合小型-中型实验室的需求。

为了满足日益增长的新一代测序需求,罗氏旗下的454生命科学公司近日宣布将在2010年推出新的普及型测序平台-GS Junior System。

GS Junior System的大小与普通的激光打印机差不多,它的性能和特征会更适合小型-中型实验室的需求。此平台将会与长读长的GS Junior Titanium试剂共同上市,测序读长约为400-500 bp。测序系统还会带有一台电脑,专为GS Junior的运行和下游数据分析而优化。

根据目前公布的数据,GS Junior System的通量为每次运行产生35 Mb以上的高质量碱基。平均读长为400个碱基,每次运行平均产生10万个读数。400个碱基的准确率为99%。文库制备仅需半天,测序需要10个小时,然后2小时处理数据。测序原理与GS FLX相似。

454生命科学的总裁Christopher McLeod预计GS Junior系统将会像个人电脑在大众中普及一样,在测序实验室中普及。他表示:“这项技术是几乎所有实验室都能拥有的。同时,我们仍将继续扩展我们的旗舰平台-GS FLX系统的性能。”

该公司还宣布即将推出GS FLX系统的一些新试剂盒、操作步骤和软件升级。这些新产品将让两个主要领域(转录组测序和PCR扩增子测序)利用400-500 bp的长读长以及GS FLX Titanium系列试剂的更高密度。另外,Rapid Library Preparation Kit将节省一半的文库制备时间,且需要的DNA量要少得多。

GS数据分析软件也经过了重大改进,有了全新的GS De Novo Assembler software,能够处理来自人筛分基因组(3Gb)和转录组的数据组。新的cDNA测序步骤和拼接软件为新物种转录组测序和分析提供了完整的方案,几乎所有物种,即使是过去未曾鉴定的物种都能获得基因空间的综合图像。

最新的GS FLX Titanium Kit为定向扩增子测序提供了新方案,它支持400 bp长扩增子的超深度测序。近年来GS FLX系统的扩增子测序为多项医学研究铺平了道路,包括对HIV感染个体中低频率药物抗体变异体的检测,以及高分辨率的HLA测序和分型。GS FLX Titanium扩增子测序将会继续推进这些研究,且每次运行的克隆读数会超过100万个。(生物通 余亮)

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