遗传学家两篇文章解析基因复活

【字体: 时间:2009年11月25日 来源:生物通

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  来自华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler接连在Nature,和PLoS Genetics杂志上发表文章,比较了四种灵长类(猕猴、红猩猩、黑猩猩和人类)的基因组序列,发现一种重要的基因变异,以及一种在4000万年前失去功能之后,又于2000万年前“复活”的基因。

  

生物通报道:来自华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler接连在Nature,和PLoS Genetics杂志上发表文章,比较了四种灵长类(猕猴、红猩猩、黑猩猩和人类)的基因组序列,发现一种重要的基因变异,以及一种在4000万年前失去功能之后,又于2000万年前“复活”的基因。

在第一篇Nature文章中,研究人员发现大约1000万年前,在大猩猩从其它猩猩和猴子中分离出来之前,它们的DNA开始出现爆炸性的变化——并非传统的变异,而是被称为复制数量变异的变化,这些DNA序列的变化可能有助于解释什么使人类和其它猿类相区别。

研究人员分析了四种灵长类(猕猴、红猩猩、黑猩猩和人类)的基因组序列,他们认为,一些在进化树上不同距离的物种可以被看作时间机器,以追踪几千年来所发生的变化。

他们发现,就整个序列来说,人类和非洲黑猩猩非常接近,主要的区别在于复制数量的变化,也就是同一个遗传序列重复的次数不同,删除的内容不同等。埃什勒说,在人类中,这些变异同艾滋病和孤独症等疾病相关,这些变异也构成了物种之间的差异的基础。

分析表明,在灵长类的分支变成非洲大猩猩和人类的过程中,这些复制的数量开始增加,同时,越来越多传统的基因变异开始缓慢减少。他们称,尤其是人类和非洲黑猩猩,这些序列的额外复制格外多。

第二篇文章中,研究人员发现一种称为免疫相关鸟苷三磷酸酶基因(IRGM)的基因,似乎很久之前已经在旧世界和新世界猴的祖先身上被摧毁了。不过当潜伏在基因组中的逆转录病毒将自身插入该基因中后,它在人类和类人猿共同祖先体内成功复活。

在多数哺乳动物中,IRGM是一个基因大家族中的成员,这一大家族中的基因被认为有助于消灭病原体,比如有关肺结核的细菌,这种细菌会侵入宿主细胞,并在其中繁衍。但是在人类和一些灵长类中,这一基因大家族消亡到只剩2名成员,IRGM 和IRGC。现在还不清楚人类是如何在失去了如此多的IRGM(家族基因)后生存下来的,相比较而言,缺乏这些基因的小鼠(比正常小鼠)更容易受到感染。

有理由怀疑IRGM在人体中可能起重要的作用,不过,研究人员已经发现,一些人的IRGM基因前部带有一个缺失,这可能改变该基因的表达并增加克罗恩氏病风险,克罗恩氏病是一种有害的消化系统自体免疫病。

Eichler和他的同事对比了人类和其他灵长类的IRGM序列。研究人员发现,分散在人类基因组中的重复DNA的一小段碎片,已经在约4000万年前插入了旧世界和新世界猴的共同祖先基因中。这一插入灭活了IRGM,废止了该基因形成功能性蛋白质的能力。

(生物通:万纹)

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