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3则研究登《Science》绘制蛋白组、转录组图谱
【字体: 大 中 小 】 时间:2009年11月27日 来源:生物通
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生物通报道,最新一期的《Science》杂志报发表了一篇关于最小细菌的生命图谱文章Proteome Organization in a Genome-Reduced Bacterium,首次全方位地了解原核生命的机制,可能会帮助科学家们确认生命所需的细胞器的最低要求
生物通报道,最新一期的《Science》杂志报发表了一篇关于最小细菌的生命图谱文章Proteome Organization in a Genome-Reduced Bacterium,首次全方位地了解原核生命的机制,可能会帮助科学家们确认生命所需的细胞器的最低要求
该研究采用最小的细菌之一(Mycoplasma pneumoniae,肺炎支原体)中的所有蛋白质的新图谱来进行研究。有关的发现表明,这种细菌的生物学的复杂性令人惊讶,而且它与真核细胞在某些方面具有相似性。
一个欧洲的研究团队在3篇相关的文章中介绍了他们的研究工作。他们描述了在M. pneumoniae生物学中的三个成分:该细菌中的完整的蛋白质组,或称“蛋白质组”;其代谢网络,以及其完整的信使RNA分子组(转录自基因)也称作其“转录物组”。
在第一则研究中,Sebastian Kühner及其同僚预期未来可能在更为复杂的生物体中所发生的情况,他们将对蛋白质相互作用的分析与有关这些蛋白质结构的资讯相结合,从而揭露了这些蛋白质是如何作为分子机器而一同工作的。 他们还对细胞中的这些蛋白质的组织结构进行了绘测。
由于M. pneumoniae的基因组的大小便于操作,使得Eva Yus及其同僚能够将该生物体的代谢网络进行图谱绘测,并在第二则研究中用实验对其进行了验证。 研究人员还研发了一种可对这种细菌进行培养的最低要求的培养基。
在第三则研究中,Marc Güell及其同僚应用最新的测序技术披露了这种“简单的”生物体具有某种与真核细胞相像的相对复杂的基因调控系统。 在一篇Perspective的文章中,Howard Ochman 和 Rahul Raghavan对所有这三项研究进行了讨论。
(生物通 小茜)
生物通推荐原文检索
"Proteome Organization in a Genome-Reduced Bacterium," by S. Kuehner; V. van Noort; M.J. Betts; A. Leo-Macias; C. Batisse; M. Rode; T. Yamada; S. Bader; P. Beltran-Alvarez; D. Castaño-Diez; W.-H. Chen; D. Devos; I. Racke; V. Rybin; B. Böttcher; A.S. Frangakis; R.B. Russell; P. Bork; A.-C. Gavin at European Molecular Biology Laboratory in Heidelberg, Germany; T. Maier; M. Güell; E. Yus; L. Serrano at Centre de Regulacio Genomica in Barcelona, Spain; T. Norambuena at Pontificia Universidad Catolica de Chile in Santiago, Chile; A. Schmidt; R. Aebersold at ETH (Eidgenössische Technische Hochschule) Zürich in Zurich, Switzerland; A. Schmidt; R. Aebersold at University of Zurich in Zurich, Switzerland; A. Schmidt; R. Aebersold at Institute for Systems Biology in Seattle, WA; R. Herrmann at ZMBH (Zentrum für Molekulare Biologie der Universität Heidelberg) in Heidelberg, Germany; L. Serrano at ICREA (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) in Barcelona, Spain; B. Böttcher presently at University of Edinburgh in Edinburgh, UK.