癌症基因组计划一周年

【字体: www.ebiotrade.com 时间:2010年01月04日 来源:生物通

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  芝加哥大学基因组和系统生物学研究院(IGSB)的研究人员近日完成了癌症基因组计划的试验阶段。这个三年的癌症基因组计划试图测定1000个肿瘤中有差异的序列。在过去的一年中,研究人员与医生密切合作,已经获得了100个肿瘤的序列,将剩余的900个留给今后两年。

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芝加哥大学基因组和系统生物学研究院(IGSB)的研究人员近日完成了癌症基因组计划的试验阶段。这个三年的癌症基因组计划试图测定1000个肿瘤中有差异的序列。在过去的一年中,研究人员与医生密切合作,已经获得了100个肿瘤的序列,将剩余的900个留给今后两年。

根据芝加哥大学Kevin White教授的说法,第一年的大部分时间花在确立和细化项目框架。该项目利用技术上最先进的基因组测序及计算分析平台,不过他没有指明该项目具体使用了哪些仪器。“我们现在知道该怎么做了,我们有了适当的基础结构。在这个过程中,我们发现了某些癌症中与临床结果相关的新基因。”

癌症是一种遗传疾病。每个肿瘤的基因都为疾病的严重程度提供了线索。它们有时能预测癌症是否会对特定治疗有反应,是否会耐受放疗或化疗,治疗后的复发和扩散。目前许多癌症疗法来自遗传信息。1958年芝加哥大学的Elwood Jensen发现了雌激素受体,导致了雌激素阻断剂tamoxifen的开发。

到目前为止,项目获得的肿瘤序列主要是白血病、乳腺癌、头颈部癌。研究人员追踪了捐献恶性肿瘤样品的患者,以将遗传数据和患者的结果相关联。White表示,该项目旨在教会他们如何利用细胞的遗传状态作为路标,来给予特定患者更好的治疗。

对于项目的剩余部分,研究人员将致力于确定肿瘤中改变的基因如何影响癌症。项目还将扩大,延伸到更多的肿瘤类型,包括膀胱癌、肺癌、胰腺癌、前列腺癌及一些儿童期癌症。根据White的说法,分析多种肿瘤将帮助研究人员分辨不同癌症类型之间的关系。

为了达到1000个序列的目标,研究人员将实行独特的研究过程。与其它项目不同,他们只研究在恶性肿瘤中表达的基因,大约占完整基因组的1-2%,这样每个肿瘤大约花费2000美元。White强调,为了达到项目要求,仍有待收集的数据量大约相当于20个完整的人类基因组。

该项目还会收集肿瘤中表达的基因如何随时间变化的遗传数据。研究人员会尽可能地比较患者治疗前后的肿瘤样品,来研究癌症如何累积其他的遗传改变,让它们耐受放疗或化疗,或扩散到其它地方。

White表示,该项目的长期目标是将基因组发现转化成有用的诊断工具和疗法。他也承认,让一小段基因组序列来改善患者健康,还有很长的路要走。(生物通 余亮)

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