中科院一博士发Plos One文章

【字体: 时间:2009年02月16日 来源:生物通

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生物通报道:来自水生生物研究所的消息,中国科学院水生生物研究所原生动物分类与生态学科组的研究人员针对嗜热四膜虫构建的世界上第一个纤毛虫全基因组基因芯片分析平台。这一研究成果公布在PLoS One上。

这项研究成果由缪炜博士和硕士生熊杰在科技部国际合作重点项目与国家自然科学基金资助下,与美国罗切斯特大学Gorovsky教授等合作完成的。

论文报道了过去两年间缪炜博士与合作者针对嗜热四膜虫构建的世界上第一个纤毛虫全基因组基因芯片分析平台。基于高通量基因表达分析技术完成了嗜热四膜虫3种典型生理或发育状态(生长、饥饿及接合生殖)共20个时期的全基因组表达数据的采集和分析,建立和发展了协同表达基因的发现等分析方法,为四膜虫功能基因组学的开展奠定了基础,被同行审稿人评价为a major milestone in molecular research on ciliates ”。

近日缪炜博士等人还在国内完成了多种环境激素类污染物(滴滴涕、二恶英、三丁基锡等) 和雌二醇暴露下四膜虫的基因芯片全基因组表达分析,使得水生所合作或独立完成了全世界近85%的四膜虫基因芯片实验,目前由中方负责的四膜虫基因表达数据库(Tetrahymena Gene Expression Database)的建立已经启动,旨在通过收集、提供和分享四膜虫基因芯片数据及相关分析方法和应用软件,使之成为世界四膜虫功能基因组学研究的信息中心。

四膜虫(Tetrahymena)是一种营自由生活的单细胞真核生物,隶属于原生动物中的纤毛门寡毛纲膜口目,广泛分布于全球各地的淡水环境中。在过去的50年中,以四膜虫为实验对象在基础生物学研究中取得了一系列突破性的成果,如端粒与端粒酶的发现、获得诺贝尔奖的核酶发现和组蛋白翻译后修饰功能的发现等。同时,四膜虫作为第一种实现细胞同步化的真核生物可以进行无菌纯培养,而且生长快(2-2.5小时一代);比较基因组的研究也显示嗜热四膜虫较酵母等模式生物和人类具有更高程度的功能保守性;加之四膜虫中已建立了成熟的基因操作技术。因此,四膜虫是开展真核生物基因功能研究的良好模式生物,基因芯片分析平台的建立将有力推动利用四膜虫在基因组水平开展真核生物重要代谢通路及基因调控网络的研究工作。

附:

缪炜,男,1974年生。1996年毕业于武汉大学生命科学学院遗传学系。1999年获武汉大学化学与环境学院生物物理专业硕士学位。2002年于中国科学院水生生物研究所获博士学位。2002年10月至2003年4月在香港浸会大学生物系作访问学者。2004年7月至2005年1月在美国加洲大学圣巴巴拉分校(UCSB)作高级访问学者。硕士生导师。主持的在研课题有:国家自然基金青年基金项目(05年1月-07年12月)、武汉市青年科技晨光计划项目(05年4月-08年3月)、中国科学院院长基金(06年6月-09年5月)和国家自然基金面上项目(07年1月-09年12月)等。现任中国动物学会理事,原生动物学分会秘书长。  

至今已在Environmental Microbiology、Protist、Journal of Eukaryotic Microbiology与Science in China等杂志发表论文20余篇,其中SCI源刊7篇,为Aquatic Toxicology 与 Journal of Eukaryotic Microbiology杂志的审稿人。目前与美国加洲大学、罗彻斯特大学和意大利卡美日诺大学均保持着密切联系并已开展相关的合作研究。招生专业及方向:原生动物分子进化和分子毒理学;主要开展与环境胁迫相关基因的发现,进化和适应等分子生态、分子毒理学方面的研究。E-mail: miaowei@ihb.ac.cn

原文摘要:

Microarray Analyses of Gene Expression during the Tetrahymena thermophila Life Cycle

The model eukaryote, Tetrahymena thermophila, is the first ciliated protozoan whose genome has been sequenced, enabling genome-wide analysis of gene expression.

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