Illumina公布测序仪发展大计

【字体: 时间:2009年02月19日 来源:生物通

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  Illumina公司近日公布了其新一代测序仪Genome Analyzer系统的发展路线,计划在2009年实现每次运行获得超过95 GB的高质量数据。该路线勾勒出试剂、算法和硬件的升级,将会显著改善准确率、读长、数据密度和易用性。

  

Illumina公司近日公布了其新一代测序仪Genome Analyzer系统的发展路线,计划在2009年实现每次运行获得超过95 GB的高质量数据。该路线勾勒出试剂、算法和硬件的升级,将会显著改善准确率、读长、数据密度和易用性。Illumina预计今年底单个流动室能产生人类基因组的25倍覆盖度,而人类基因组的测序费用降低至1万美元以下。

以Genome Analyzer现在的配置,每次运行能产生15 GB以上的高质量数据。以此为基础, 2009年Genome Analyzer的性能会提升6倍以上。这些改进将分几个阶段进行,并包括以下元素:

• 试剂改良,包括使用全新的聚合酶,让运行速度更快,配对片断超过2×100 bp。这些改进有望提高测序准确性,实现2×100配对末端阅读片断的准确性超过98.5%,2×50 配对末端片断则超过99.9%。

• 硬件升级,包括流动室支架改进和试剂冷却器增容,不仅能增加产量,还能实现至少100个循环的无人值守自动化。这些硬件将组成Genome Analyzer 升级试剂盒,现在的用户也能立即订购,享受升级的乐趣。

• 算法改进,包括检测簇的新方法,将让高密度流动室的产量提高80%,并改善碱基检出的准确性。

• 数据密度增加,通过利用1微米及亚微米特征的半有序阵列。这些有序的阵列,以及读长的增加,有望在每次运行中分别产生55和95 GB的数据。

这些改进不仅增加了Genome Analyzer的产量,降低了测序费用,还大大扩展了它的应用空间。Illumina生命科学部的副总裁Joel McComb表示:“作为应用最广的新一代测序平台,Genome Analyzer已发表论文200多篇,并让世界各地的科学家快速经济地进行突破性的研究。经过2009年的系统升级,我们预计Genome Analyzer将继续成为众多应用中的灵活工具,包括大规模全基因组分析、从头测序、宏基因组学等,并将加快人类健康、生物多样性和环境的探索速度。”

关于Illumina

Illumina公司 (www.illumina.com)是全球领先的新一代生命科学工具的开发和生产者,并开发大规模分析遗传变异和生物功能的集成工具。我们利用专利技术,为测序、基因分型和基因表达提供全面的产品和服务,还将进入分子诊断市场。我们的客户包含一流的基因研究中心、药厂、研究院、临床研究机构和生物公司。我们的工具有足够的表现力、通量、成本效益和灵活性,使全世界的研究者能通过遗传实验来得到有价值的信息。我们相信这个信息能使研究者把遗传变异与生物功能关联起来,从而加大药物开发和临床研究,让疾病能更早地检测出来,为患者提供更好的药物。

(生物通 余亮)

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