中科院完成猪源性H1N1全基因组分析测序

【字体: 时间:2009年05月13日 来源:中科院北京基因组所

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  基因组所继5月4日完成由武汉病毒研究所提供“猪流感H1N1型病毒A/Swine/Hubei/01/2007”部分基因测定和分析工作后,于5月10日已基本完成此样本的全基因组测序和数据分析。

  

基因组所继5月4日完成由武汉病毒研究所提供“猪流感H1N1型病毒A/Swine/Hubei/01/2007”部分基因测定和分析工作后,于5月10日已基本完成此样本的全基因组测序和数据分析。

      目前,所获得序列已占该病毒株全基因组序列的94.73%,全基因序列的覆盖度则达到了98.34%。经与其他来源的猪流感病毒进行对比,发现与1986年分离的一株H1N1亚型人流感病毒(A/Singapore/6/1986),以及2006年分离的一株H1N1亚型猪流感病毒(A/swine/Henan/01/06)相似度最高,可能为其来源。而与2009年最新流感病毒的相似性比较,差异较为明显(77%-88%),表明两个病毒应为不同来源。

      同时,通过进化分析,发现此次流行的最新流感病毒不是突然出现的,而是一直就在世界各地的猪身上传播繁衍,且与在人类传播的H1N1病毒有较大的差异,其拥有的禽流感病毒的特征也许是最近爆发并迅速蔓延的原因。而我国猪H1N1亚型流感病毒则与之分属不同的进化分支,其同源性不高,不是本次爆发的流感的病毒,危险性相对较低。

      目前,基因组所正在不断的补充和完善数据,为我国防治疫情做好科研基础工作。

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