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SOLiD 3单次运行可产生50 Gb人基因组序列数据
【字体: 大 中 小 】 时间:2009年05月13日 来源:生物通
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美国应用生物系统公司(Applied Biosystems)今日宣布该公司研究人员已成功在在SOLiD 3 测序仪的单次运行中产生了高达50 Gb(gigabase)的人类基因组序列数据,相当于人类基因组的17倍覆盖度。
美国应用生物系统公司(Applied Biosystems)今日宣布该公司研究人员已成功在在SOLiD 3 测序仪的单次运行中产生了高达50 Gb(gigabase)的人类基因组序列数据,相当于人类基因组的17倍覆盖度。
这次的配对末端数据是在与贝勒医学院人类基因组测序中心(HGSC)合作的研究项目中产生的,贝勒医学院人类基因组测序中心提供了测序样本,它来自一位患有某种遗传病的个体。
作为与贝勒医学院人类基因组测序中心(HGSC)合作的第二个项目的一部分,ABI研究人员利用SOLiD对来自人脑癌症样品进行测组,在单次运行中产生了30 Gb数据,相当于人类基因组约10倍的覆盖度。
美国应用生物系统公司表示,在这些项目中使用的SOLiD系统已安装了全新的微珠搜获和定量基因组分析软件。
该公司发言人表示,人类基因组测序中心的成员David Wheeler,他同时也是一位分子和人类遗传学的副教授,将于今天晚些时候在冷泉港实验室的基因组生物学年会上展示这些项目的数据。
根据美国应用生物系统公司的说法,人类基因组测序中心目前已经拥有10台SOLiD系统,用于包括癌症和遗传病在内的多种人类疾病的研究项目。
一年前,人类基因组测序中心宣布购买了6台SOLiD仪器,计划将其用于千人基因组计划。(详情请看In Sequence 4/29/2008)
(ABI供稿,生物通翻译)