PNAS，Cancer Res两项重要的癌症成果

抗击癌症是多年来科学家们的一个重要努力方向，近期在癌症机理方面获得了两项重要的成果，分别发表在Cancer Research和PNAS杂志上。

　　

生物通综合：抗击癌症是多年来科学家们的一个重要努力方向，近期在癌症方面获得了两项重要的成果，分别发表在Cancer Research和PNAS杂志上。

Cancer Research：生物信息学找到可能的癌症

约翰霍普金斯大学的研究人员设计出一种全新的计算机软件，该软件能同时对几百个基因突变进行筛选，并将最可能导致癌症的DNA突变筛选出来，该方法被命名为CHASM(Cancer-specific High-throughput Annotation of Somatic Mutations)，将使科学家将更多的注意力集中到引发肿瘤的突变上。

该研究报告发表在8月15日出版的Cancer Research杂志上。

这项新方法着重对错义突变(missense mutations)进行研究，课题组首次利用计算机方法缩小到600个左右的疑似脑部肿瘤突变，并分选出那些突变在引发癌症过程中起“主导(drivers)”和“随从(passengers)”的突变。“主导突变”即能引发并促进肿瘤生长的突变。“随从突变”即在肿瘤生长过程中出现但对肿瘤的形成和生长没有影响的突变。

在分选之前，研究人员利用机器阅读技术把癌症相关的约50种突变的特征输入到系统中，然后研究人员Karchin和Carter采用Random Forest classifier的数学方法将主导突变和随从突变分开，在这一步里，每一个突变都要经过500个计算“决定树(decision trees)”以区分该突变是否具有引发癌症的特征。

最有可能的突变——主导突变——将被放在名单前列，而将随从突变置后。这样，研究人员在该软件的帮助下，就可以更省时省力的找出引发癌症的最有可能的突变体。
 

PNAS：非编码RNA可控制癌症转移

耶鲁大学医学院和中国四川大学的科学家在9月7-11日的《美国科学院学报》的两篇论文中报告说，一小段此前不知道其功能的遗传物质可能是制止癌症扩散的关键。

在这些论文中，耶鲁大学分子生物物理学与生物化学系的Alan Garen和他的同事Xu Song解释了癌症如何能够战胜生物体的天然的细胞分裂“停止信号”。

在早期发育阶段，干细胞形成了其他细胞，后者分化成了各种类型的组织。随着生物体的成熟，新的细胞分裂和增殖停止了。然而，癌能够劫持这个过程，并触发不受控制的细胞分裂，产生癌肿瘤。

制止细胞增殖的一种机制是一组肿瘤抑制蛋白（TSP），它们与原癌基因（即有潜力触发癌症的基因）结合并阻断其功能。

Garen的研究小鼠的研究组发现来自基因组中并不产生蛋白质的一个区域的RNA分子阻止了一种TSP关闭这些原癌基因。他说，他们研究的这种TSP称为PSF，这是一种在小鼠和人类体内几乎一样的蛋白质。

耶鲁大学的这个研究组通过增加PSF的量或者减少细胞中的非编码RNA的量，从而阻止了小鼠的肿瘤形成。

“小鼠癌症模型的肿瘤细胞停止增殖，肿瘤衰退，这提示着两种方法都可以成为一种临床方案的基础，”Garen说。Garen也是耶鲁大学癌症中心的成员之一。

Garen和他的同事打算继续研究调控细胞中与PSF结合的RNA的数量的机制，他们认为这是癌起源的关键。