F1000最新推荐：七大遗传学论文

　　

生物通报道：“F1000（Faculty of 1000 Medicine）”又名“千名医学家”，是由美国哈佛大学和英国剑桥大学等全世界2500名国际顶级医学教授组成的国际权威机构。其中近期最受关注的七篇遗传学论文如下：

CM Sharma et al, Nature, 464:250-5, 2010. Evaluated by N. Ahmed, Institute of Life Sciences, India; M. Hensel, Friedrich-Alexander University Erlangen-Nuremberg (FAU); S. Ho Sui and F. Brinkman, Simon Fraser University; S. Vogt and T. Raivio, University of Alberta; A. Danielli and V. Scarlato, University of Bologna.

幽门螺杆菌是一种单极、多鞭毛、末端钝圆、螺旋形弯曲的细菌。长2.5～4.0μm，宽0.5～1.0μm。革兰染色阴性。有动力。在胃粘膜上皮细胞表面常呈典型的螺旋状或弧形。在固体培养基上生长时，除典型的形态外，有时可出现杆状或圆球状。

幽门螺杆菌感染是慢性活动性胃炎、消化性溃疡、胃黏膜相关淋巴组织(MALT) 淋巴瘤和胃癌的主要致病因素。1994年世界卫生组织/国际癌症研究机构 (WHO/IARC) 将幽门螺杆菌定为Ⅰ类致癌原。

幽门螺旋杆菌感染大约一半的人口，能在胃中的酸性条件下生存。该细菌的大多数携带者是没有症状的，但有些人则会有炎症、溃疡和胃癌。现在，利用一种选择主转录体的5'端的新方法，研究人员已经确定了幽门螺旋杆菌（主要是未经处理的信使RNA和小型非编码RNA）在各种不同生长条件下的“主转录组”。结合以前已发表的基因组序列和蛋白“相互作用组”，这项工作将为普遍使用的幽门螺旋杆菌菌种26695提供第三组普适性参照数据。

C. Gregg, et al., Science, 329:643-8, 2010. Evaluations by R. Sapolsky, Stanford University; ME Carter and L. de Lecea, Stanford University; J. Messing, Rutgers University; Y Ikeuchi and A Bonni, Harvard Medical School; D Sweatt, University of Alabama at Birmingham.

大脑表观遗传学

J. Tcherkezian, et al., Cell, 141:632-44, 2010. Evaluations by K Kwan and CB Chien, University of Utah; J Heraud and M Kiebler, Center for Brain Research, Medical University of Vienna, Austria; W Kroeze and B Roth, University of North Carolina; L Desgroseillers, University of Montreal, Canada; L Columbus, University of Virginia.

蛋白翻译新发现，这篇文章也是Cell杂志当月倍受关注的一篇文章。

H. van Bakel et al. PLoS Biol, May; 8(5):e1000371, 2010. A Siepel, Cornell University; S Macdonald, University of Kansas; A Sellam and A Nantel, National Research Council of Canada; D Reines, Emory University School of Medicine.

多伦多大学（University of Toronto）的科研小组揭开了分子生物学家称之为“暗物质”转录产物背后的神秘面纱。这个研究结果发表在PLoS Biology在线版上。

所谓 “暗物质”是指不是来源于已知基因，而是来自“无用DNA”区域的基因组产物。当发现遗传信号，即RNA转录产物是来自这些区域后，许多人认为这里存在着一个全新的问题需要解决，而这比之前预测的可能更为复杂。

然而，由来自班亭和拜斯特医学研究部（Banting and Best Department of Medical Research）和细胞和生物分子学研究部特伦斯唐纳利中心（Terrence Donnelly Centre for Cellular and Biomolecular Research）的Harm van Bakel博士后研究员和Timothy Hughes教授领导进行的一项研究表明：大部分这些信号可能是来源已知基因信号的副产物。研究还表明，相对于有意义的信号，其它的大多数信号与背景噪音更一致。

其神秘性还有部分是来自于研究方法。之前很多有关“暗物质”信号的研究报道利用的都是“Tiling芯片”，而这将会造成大量假阳性的出现。但是最近研究使用的能够对大量转录产物进行测序的方法，就使得科学家能够确定原因不明的暗物质仅占总暗物质的2%，比原先认为的要少得多。在这2%中，又有大部分是与已知基因非常接近的，这就表明它们很可能就是基因本身的一部分。

大多数暗物质转录产物可能与已知基因有关的事实就表明，这些信号并不是来自于基因组背后的隐秘世界。虽然，现在就排除其的一些功能作用还为时过早，但是暗物质转录产物可能主要是正常基因表达的副产物。

P. Wang et al., Curr Biol, 2010 May 26, 20:1099?1103. Evaluated by R Kishony, Harvard University; T Meier, Max Planck Inst Biophysics; Yves Barral, ETH.

DW Hailey et al. Cell, 141:656-67, 2010. Evaluated by R Gross, University of Wuerzburg, Germany; M Markaki and N Tavernarakis, Foundation for Research and Technology-Hellas, Greece; Y Xiang and Y Wang, University of Michigan, E Lau and Z Ronai, The Burnham Institute.

Z. Kan et al, Nature, 466:869-73, 2010. Evaluated by T Ried, National Cancer Institute; D Nierlich, University of California, Los Angeles; S Gutkind, National Institute of Dental and Craniofacial Research.

来自Genentech、Affymetrix和宾夕法尼亚州立大学的研究人员使用错配修复检测技术和互补方法，发现了几种人类癌症中的体细胞突变。

研究人员聚集于几百个乳腺、肺、卵巢、前列腺和胰腺肿瘤中大约1500个编码基因，发现了近2600个体细胞突变，包括2400多个过去未曾报道过的。正如预料的那样，突变种类和突变频率随肿瘤类型而异，不过多个受影响的基因往往落入肿瘤相关的通路。

研究人员使用了错配修复检测技术以及Affymetrix的tiling array技术，检测441个肿瘤中大约400万个DNA碱基中的体细胞突变，这些肿瘤包括183个乳腺肿瘤、134个肺部肿瘤、58个卵巢肿瘤、58个前列腺肿瘤和8个胰腺肿瘤。

研究小组发现了2576个体细胞突变，影响了967个基因。其中95%的突变是新的，在过去的癌症研究中未曾报道或不在数据库中。在经常突变的基因中，研究人员检测了一些蛋白激酶基因和编码G蛋白偶联受体的基因。尽管突变常常发生，但突变的频率和性质通常随肿瘤类型而异，显示出癌变遗传机制的复杂性。

同时，研究小组的统计分析揭示，有77个基因在所检测的肿瘤类型中明显更可能突变，包括肺鳞状细胞癌的19个基因和肺腺癌中的18个基因。当他们使用罗氏454测序来查看另外50个肺部肿瘤中一些新检测到的突变时，研究小组发现在这些样本中部分相同基因的突变频率相当。

“Faculty of 1000 Biology”创办于2002年1月，是一种在线科研评价系统，其推荐原则立足于论文本身的科学意义而非发表在什么杂志上。该系统根据全球2300多名资深科学家的意见，提供对近期发表的生物科学论文的快速评论，目的是帮助广大科研人员遴选和发现有价值的研究工作。该机构专家根据论文对当前世界生物医学和临床实践的贡献程度和科学价值，每年对全球SCI文章总数不足千分之二的优秀精品医学论文进行推荐和点评，并赋予“F1000论文”称号向医学界推荐，涵盖了医学各个学科，是一项很高的学术荣誉。

（生物通：万纹）