Cell杂志最受关注十篇文章（11月）

　　

生物通报道：Cell创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主，许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。本月《Cell》前十名下载论文为：

1. A Myc Network Accounts for Similarities between Embryonic Stem and Cancer Cell Transcription Programs
Jonghwan Kim, Andrew J. Woo, Jianlin Chu, Jonathan W. Snow, Yuko Fujiwara, Chul Geun Kim, Alan B. Cantor, Stuart H. Orkin
MyC癌基因作为最早发现的原癌基因，现在已经30岁了。作为癌基因的先行者（Pioneer），今天已经发展成为一棵参天大树；累计发表了23000篇学术论文，有力地推动了整个细胞生物学和癌生物学的发展。至今仍然青春焕发，光芒四射。现在它又作为MicroRNA和干细胞的调节者，将再为人类生命科学的宏伟画卷，画上浓彩绚丽的一页。

MyC癌基因最先是从禽细胞（AMN-MC29）中分离和克隆出来，现在证明它属于一类核基因家族，其成员主要有C-MyC、N-MyC和L-MyC，其表达蛋白质在体内主要起转录因子的作用，它可与Max、Mxd或Mnt等组成复合体，调控体内一千多种基因的转录和表达。它可通过细胞周期调节细胞的生长、存活、增殖、分化、代谢、凋亡和转移。此外，它还可以调节Ribosomase、蛋白质和线粒体的合成和血管生成；激活和调节线粒体和细胞内多通道代谢网络（Multiple Metabolic Network）；参与DNA复制、维持和调节染色体和基因的稳定性；调节多种RNA聚合酶的表达和生成。因此，有人称它是“Maestro of an Unfolding Symphny of cell growth、Proliferation、 Death and Metabolism”。最近，又发现MyC癌基因还是体内干细胞的最关键调节基因之一，它可以抑制干细胞分化，维持干细胞自我重制（Self-Renewal）和干细胞多潜能状态（Pluripotoncy）。

2. Systematic Protein Location Mapping Reveals Five Principal Chromatin Types in Drosophila Cells
Guillaume J. Filion, Joke G. van Bemmel, Ulrich Braunschweig, Wendy Talhout, Jop Kind, Lucas D. Ward, Wim Brugman, Inês J. de Castro, Ron M. Kerkhoven, Harmen J. Bussemaker et al.
转录活性常染色质与受阻遏异染色质的染色质传统分类曾是一个有用的模型，但它应该进行升级，以适应人们日益增加的有关染色质功能域的知识。一项在果蝇中对与蛋白质有关的53种染色质进行的大规模综合性全基因组分析表明，染色质有五种主要类型；这些可以构成描述表观基因组的新框架。

阿姆斯特丹市荷兰癌症研究所的Guillaume J. Filion和同事从染色质蛋白质组中选择了一组宽泛的蛋白质，并利用DamID方法在一个胚胎果蝇细胞株中绘制了它们的基因组位置。在这项技术中，每种感兴趣的蛋白质都被混合了DNA腺嘌呤甲基转移酶（Dam），它利用一个甲基腺嘌呤足迹标记了蛋白质—DNA的相互作用位点。研究人员随后利用一种数据驱 动的计算分类策略在整个基因组中鉴别出了周期性的、完全不同的蛋白质组合。基因组区域——长度从1kb变化到100多kb——通过它们的蛋白质信号而分成 了5个清晰的类别，并且研究人员给每一个类别赋予了一个有颜色的名字。

绿色类和蓝色类染色质与两种之前定义的受阻遏异染色质类型相一致：“典型的”异染色质包 括异染色质蛋白质1（HP1）、（绿染色质）和多梳组（PcG）关联染色质（蓝色染色质）。利用染色质免疫沉淀反应，Filion等人还发现组蛋白在绿色 和蓝色区域改变了，这与这些异染色质亚型之前的认知相匹配。

引人注目的是，研究人员发现受阻遏异染色质的最丰富的形式——覆盖了48%的基因组并且 能够形成大的区域（>100 kb）——是一种新类型（被命名为黑色）。尽管黑色染色质域相对基因贫乏——它们包含了大于4000个基因，Filion等人发现这些基因没有或只有非常 有限的转录活性。插入黑色区域的报道转基因通常都是受阻遏的，这意味着黑色染色质的活性抑制了转录。在胚胎细胞的沉默黑色区域中的基因在一些其他的组织中 也有表达，因此研究人员推测这种形式的染色质或许与发育调控有关，至少是部分相关。

3. TGF-β and Insulin Signaling Regulate Reproductive Aging via Oocyte and Germline Quality Maintenance
Shijing Luo, Gunnar A. Kleemann, Jasmine M. Ashraf, Wendy M. Shaw, Coleen T. Murphy

4. DNA Damage-Mediated Induction of a Chemoresistant Niche
Luke A. Gilbert, Michael T. Hemann
麻省理工学院的生物学家解析了癌细胞逃避化疗的机制。研究人员在对小鼠淋巴瘤的研究中发现有少量的癌细胞能够通过躲藏在胸腺中逃避化疗。胸腺中大量的生长因子保护这些细胞逃逸了化疗药物的“追杀”。研究的负责人、麻省理工大学生物学教授Michael Hemann认为这些细胞有可能是导致肿瘤复发的根源。

研究人员计划很快在小鼠体内开展试验，检测抗关节炎药物对于其中一个保护因素的干扰效应。研究人员认为用抗关节炎药物联合传统的化疗将给予肿瘤双重打击，清除残存的肿瘤细胞，防止癌症复发。
研究人员用一种广谱抗肿瘤药物阿霉素治疗患淋巴瘤的小鼠。他们发现在治疗过程中，血管细胞释放出细胞因子（一类可影响免疫反应及细胞分化的小蛋白）。虽然对确切的机制不清楚，研究人员相信化疗诱导的DNA损伤激发血管细胞启动了应激反应，释放了促细胞生存的生长因子例如IL-6。
这是科学家们第一次验证化疗可在肿瘤微环境中激发保护信号，从而保护癌细胞免于药物效应。研究人员称新发现为他们提供了几个有潜力的药物靶点包括IL-6和Bcl2。此外，虽然目前还仅是在胸腺中观察到这一保护效应，但研究人员相信除了胸腺，人体应该还有其他的区域供肿瘤细胞躲藏，例如骨髓。

5. Nucleosome-Interacting Proteins Regulated by DNA and Histone Methylation
Till Bartke, Michiel Vermeulen, Blerta Xhemalce, Samuel C. Robson, Matthias Mann, Tony Kouzarides

6. Long Noncoding RNAs with Enhancer-like Function in Human Cells
Ulf Andersson Ørom, Thomas Derrien, Malte Beringer, Kiranmai Gumireddy, Alessandro Gardini, Giovanni Bussotti, Fan Lai, Matthias Zytnicki, Cedric Notredame, Qihong Huang et al.
长非编码RNAs是哺乳动物转录组的重要成分，但是其功能目前并不十分清楚，在这篇文章中，研究人员发现了1000多条长的非编码RNAs在多个细胞系中的表达情况。

7. Biological Applications of Protein Splicing
Miquel Vila-Perelló, Tom W. Muir

8. Retraction Notice to: Assembly of Endogenous oskar mRNA Particles for Motor-Dependent Transport in the Drosophila Oocyte
Alvar Trucco, Imre Gaspar, Anne Ephrussi

9. Imaging Activity-Dependent Regulation of Neurexin-Neuroligin Interactions Using trans-Synaptic Enzymatic Biotinylation
Amar Thyagarajan, Alice Y. Ting

10. The Myc Connection: ES Cells and Cancer
Michael E. Rothenberg, Michael F. Clarke, Maximilian Diehn

Myc癌基因是一类核内癌基因，它不仅可以扩增，亦可易位和重排，从而被激活，使细胞去分化、无限增殖、永生化、产生不死性，进而诱发肿瘤的发生和转移。因此，MyC癌基因在肿瘤的发病、诊断和防治中占有十分重要的地位。

MyC癌基因参与DNA复制、维持和调节染色体和基因的稳定性，调节多种RNA聚合酶的表达和生成。因此，有人称它是“Maestro of an Unfolding Symphny of cell growth、Proliferation、 Death and Metabolism”。最近，又发现MyC癌基因还是体内干细胞的最关键调节基因之一，它可以抑制干细胞分化，维持干细胞自我重制（Self-Renewal）和干细胞多潜能状态（Pluripotoncy）。
（生物通：万纹）