OpenArray实时定量PCR系统 让定量分析更快更经济[新品推荐]

【字体: 时间:2010年04月19日 来源:生物通

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  OpenArray® 实时定量PCR平台加速了基因组探索、验证和检测,实现了前所未有的基因覆盖和样品通量。一个用户仅在一个工作日内就能以快速灵活的形式轻松获得30,000个数据点,让很多项目能在几天内完成,而不是几个星期。

去年生物通给大家介绍了TaqMan OpenArray 基因分型系统,该系统以基于PCR的方式对成千上万个样品中的几十个甚至几百个靶点进行SNP分析。系统流程相当地简单,一个人在一天内就可进行9万多个基因分型分析,而用户操作极少,也无需机器人的协助。一年后,Applied Biosystems带来了同样快速经济的OpenArray®实时定量PCR系统。此平台加速了基因组探索、验证和检测,实现了前所未有的基因覆盖和样品通量。一个用户仅在一个工作日内就能以快速灵活的形式轻松获得30,000个数据点,让很多项目能在几天内完成,而不是几个星期。平板有五种分析/样品形式(图1),能上样预设计或定制TaqMan® 或SYBR® 分析的任意组合。

OpenArray® 平台与类似平台相比,性能更佳,且更易使用。您选择的分析预先加入OpenArray® 平板的指定通孔中并脱水干燥。只需将您的样品与预混合液混合,上样到OpenArray® 平板,密封,循环并成像。OpenArray® 实时定量PCR系统的简单流程让一个人每天能处理最多576个样品,而无需使用机器人。

对于每个数据点,OpenArray® 平台的自身测定、纳米射流设计仅使用33 nL反应体积,让每个TaqMan® 或SYBR® 分析合成能提炼出更多反应,并帮助节省您的经费。OpenArray® 平台同时提供了高性能和重复性(表1),因此您能确信您的结果。

图1. OpenArray® 实时定量PCR平板有这几种形式。选择最适合您的分析-样品配置,或联系我们,以设计出满足您的研究目标的布局。平板可容纳最多48个样品及最多224个分析。18-assay的形式提供了18个分析,重复三次,通过技术重复的使用以获得更佳的统计分析。

OpenArray® 平台加速多个实时应用
OpenArray® 实时定量PCR系统在过去无法达到的规模简化了基因组探索和验证,病原体检测及生物标志物的鉴定和筛选。它促成了一种简单的方法,来剖析miRNA,检测并定量病原体,验证芯片结果并开展基于表达的生物标志物筛选——这些应用已被我们广大的客户群所评估,获得了重大成功。

药物靶点的验证
因其高度灵活的形式,对验证研究而言非常理想。当您需要检测10-1000个样品的10-1000个基因时,OpenArray® 系统是最快的捷径。最近,一个制药公司使用OpenArray® 实时定量PCR平台验证了表达谱实验的靶点。从靶点验证的传统微滴定板方法转换过来,能缩减大笔费用,节省时间,并实现一个更高效的流程。

药物开发
TaqMan® 试剂通常用于生物标志物和毒理学项目中验证芯片结果和筛选大量样品的分析。OpenArray® 实时定量PCR系统最近用于药物开发环境中,以简化开发和验证的工作。

农业分子检测
最近,著名的国际植物研究机构和大型动物兽医检测实验室开始使用OpenArray® 实时定量PCR系统来检测病毒、真菌和细菌病原体。OpenArray® 平台的灵活性让农业诊断学研究人员能非常快速地在打击名单中加入新的病原体,并在一天内检测超过500个样品,每个重复三次。

MicroRNA图谱分析
OpenArray® 实时定量PCR平台提供了一种流畅而不复杂的方法,用于miRNA图谱分析。研究人员能够使用探索的方法或者定向的方法,关注少数作为生物标志物的miRNA并筛选多个样品。

表1. TaqMan® OpenArray® 实时定量PCR的性能参数。

基于无模板对照的特异性

无明显扩增

利用标准曲线方法的效率

90-110%

100个拷贝的重复样品的精确度

标准偏差 < 0.25 Ct

反应密封性,定义为空的孔中无扩增

>99%的孔

三块OpenArray® 平板的上样时间(8064个反应)

<30 分钟

从纯化的DNA到实时定量数据的时间

~3 小时

一天内一个技术员的通量

>30,000个反应(576个样品)

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OpenArray®实时定量PCR系统的优势:

• 更多重复——每块板产生超过2500个数据点,实现技术重复,以获得更佳的统计能力
• 实现更快速的结果——一个人每天能产生超过30,000个基因表达数据,无需机器人,加快结果的获得
• 简单的流程让直接劳动降至最低—每块OpenArray® 平板带有您选择的分析—只需加入样品和预混合液,循环并成像
• 促进了实验灵活性——选择预设计或指定您自己的定制分析,并选择最适合项目需求的样品/分析形式
• 可靠且经济——使用熟悉的分析试剂,包括TaqMan® 或SYBR® 分析,纳米射流设计降低试剂用量

附:OpenArray® 平台技术

OpenArray® 平台技术是广泛应用的纳升射流技术平台,用于小体积液态反应。使用这项技术的研究人员将得益于微阵列的并行性和液态反应如PCR的数据质量。

OpenArray® 平台技术利用显微镜载玻片大小的平板,上面有3072个通孔。每个通孔的直径为300 μm,深度也为300 μm。平板以48个子阵,每个64通孔的形式排列。分析(最多48个样品)预装在平板上并脱水,一旦到货,可立即使用。

平板表面经过专利处理的包被,是疏水的,而通孔内部是亲水且生物兼容的。处理中,通过表面张力的作用,3072个通孔中的每一个都含有33 nL液体。

(感谢Applied Biosystems供稿。如欲投稿,请发送至投稿信箱ebtservice@sina.com

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