创新参选:直接用标本保存液来开展PCR

【字体: 时间:2010年04月23日 来源:生物通

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据华南农业大学的刘博士介绍,有些标本无需经过DNA纯化这一步,就能直接用标本保存液来开展PCR。

项目:跳过DNA提取,直接用标本保存液来开展PCR

背景:DNA提取是许多分子生物学实验的第一步,譬如PCR、克隆和测序。然而,现代的PCR酶如此强大,让我们有些怀疑这一步是否必需。研究表明有少量的DNA会从组织渗漏到保存液(通常为酒精)中,也许这部分DNA恰好能被标准的PCR步骤所扩增。于是,我们检验了这种方法的可行性。

方法改进:我们使用了含有蝴蝶幼虫的酒精。取50 ml酒精放在56°C恒温箱中挥发,将残留物溶解在50 µL纯水中。将此溶液上样到Qiagen MinElute离心柱上,以去除PCR抑制剂,之后DNA重新溶解在50 µL水中。

我们还将类似的方法使用在新鲜采集的标本和保存在95%乙醇中的旧标本(昆虫和植物叶片)中。新鲜的标本放置在2 ml 95%乙醇中。24小时后,将1ml乙醇转移至新管中,并让乙醇在56°C挥发约30分钟。对于保存在95%乙醇中的标本,我们使用1ml乙醇防腐剂作为起始材料,在56°C挥发。残留的DNA溶解在30 µL纯水中。对于所有样品,我们取2 µL DNA溶液,进行随后的PCR扩增。

我们使用标准的条件和引物,从酒精样品中扩增出130 bp和658 bp的细胞色素C氧化酶1(CO1)片段。我们还从新鲜采集的昆虫标本中扩增出核糖体28S rDNA,从所有植物标本中扩增出rbcL的部分片段。利用直接从95%乙醇中获得的DNA,我们成功扩增了动物CO1(25/25)和28S rDNA(24/25),以及植物rbcL(45/45)。

结果:我们的结果表明DNA提取并非必需,残留在保存液中的DNA可通过一个简单的PCR反应来稳定扩增。

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