通往蛋白质组:ProtoArray人蛋白芯片[新品推荐]

【字体: 时间:2010年07月28日 来源:Invitrogen

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  Invitrogen开发出一种高内涵、实用的人源蛋白芯片,可作为生物标志物的发现工具,用于鉴别针对超过9000余种全长天然蛋白的自身抗体的存在。

许多疾病状态,包括自体免疫疾病和癌症,都具有存在针对自体抗原(自身抗原)的抗体的特征。这些循环抗体或它们的抗原靶点可充当潜在的生物标志物,从而构成诊断和治疗诊断分析的基础。Invitrogen开发出一种高内涵、实用的人源蛋白芯片,可作为生物标志物的发现工具,用于鉴别针对超过9000余种全长天然蛋白的自身抗体的存在。

令一系列范围广阔的探索项目成为可能
利用免疫应答生物标志物图谱分析应用,令很多探索项目都成为可能(图1)。研究人员有能力以前所未有的速度发掘候选的生物标志物。有了ProtoArray® 人蛋白芯片,您有能力发现下列情况的生物标志物:

  • 疾病诊断和预后
  • 疾病分类
  • 疾病的发病机理
  • 药物的效力和毒性
  • 对疗法的反应

图1. 生物标志物开发的简单图谱分析方案。ProtoArray® 芯片被一种合成的封闭剂封闭,并与包含自身抗体的生物体液杂交。随后清洗玻片,以去除所有未结合的蛋白/抗体。之后用结合有Alexa Fluor® 647染料的同型特异的二抗来检测与关联抗原相结合的自身抗体。

高内涵的人蛋白芯片
我们高内涵芯片上的蛋白是利用N端融合GST蛋白的杆状病毒表达系统表达的。蛋白在非变性条件下纯化,并点在1×3英寸的由超薄硝酸纤维素(nc)包被的玻璃片基上,每种蛋白平行点两次。每张芯片都标有独特的条形码标记,以便于追踪。ProtoArray® 芯片可用市售的荧光芯片扫描仪进行读取。

Invitrogen免费的数据分析软件ProtoArray® Prospector可以快速便利地对抗体-抗原相互作用进行分析,此工具可在www.invitrogen.com/protoarray上获取(图2)。ProtoArray® Prospector软件包括了线性的标准化算法,便于多次检测之间的数据分析,以及用于跨组比较的M-统计学算法,这对生物标志物的鉴定是非常重要的。这些统计学工具让您准确灵敏地快速检测出候选的生物标志物。

图2. ProtoArray® 人蛋白芯片技术。A. 高内涵的ProtoArray® 人蛋白芯片包含了数千个全长的人蛋白,用于快速的图谱分析和轻松的生物标志物发现。B. ProtoArray® Prospector软件是一种用户友好的工具,能实现快速的数据分析和跨组比较。

ProtoArray® 技术的优势
生物标志物开发项目需要高度灵敏且可重复的方法,以对人蛋白质组中一个有效的部分进行求证。过去,双向凝胶电泳再加上基于质谱的鉴定方法常用于发现健康和疾病样品中差异表达的蛋白。然而,这项技术昂贵且耗时,需要大量的样品,且偏向于鉴定高丰度蛋白。相比之下,ELISA技术早已广泛确立并且可自动化,能够检测低丰度蛋白;不过,它的应用却要求预先了解生物标志物特性的知识,因而它不能作为开发工具去发现未知的生物标志物。ProtoArray® 技术解决了这些挑战中的几个,成为开发生物标志物项目中的一种创新工具,可实现:

高内涵的发现
即时的蛋白鉴定
低样品和试剂需求
高灵敏度
有功能的天然蛋白
快速、经济的图谱分析
可重复的筛选

具体地说,ProtoArray® 技术所提供的高水平灵敏度和重复性,使它从其它基于蛋白质组学的开发平台中脱颖而出。低至10 μL的血清或血浆即可通过稀释缓冲液上样至芯片,实现了直接在芯片上检测特异的自身抗体-抗原间相互作用。该应用无需预先标记或加标签,使之成为蛋白质组学开发项目的理想选择。

ProtoArray® 蛋白芯片技术能够对多个样品进行可重复的图谱分析。分析之间和分析内的重复性对生物标志物开发项目的成功非常重要,其中很多样品是在不同的时间由多个操作人员进行图谱分析的。ProtoArray® 芯片的开发和生产过程中包含了明确的方案步骤,标准化算法和蛋白质量控制标准品,确保其具有重复的图谱分析能力,这对生物标志物发现项目的成功很重要。表1显示了同一批次和不同批次的ProtoArray® 芯片的分析重复性。

免疫应答生物标志物图谱分析的选择
ProtoArray® 免疫应答生物标志物图谱分析应用可作为一个单独的产品,也可以作为一项定制服务提供。此服务为您的生物样品提供分析,并在4-6周内提供一份详细的报告。这种图谱分析服务包括:

一份完整的报告,详细注明实验方案,您的结果及群体统计
一份最佳的候选生物标志物列表以及它们在患病或治疗组中的普遍性(几率)
ProtoArray® 图像文件和原始数据,编排成FTP可传输的电子文件格式
在项目的完成期间,您将获得快速响应的支持和专人服务

如果您对免疫响应生物标志物图谱分析感兴趣,请点击此处索取资料

 

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